起床不刷牙就喝水存在多方面不良影响，口腔细菌会随水进入体内，长期可能增加胃肠道感染风险，儿童口腔自洁弱更易受影响；不刷牙喝水无法清洁牙齿残留物质易致龋齿，青少年牙齿发育关键期危害更显著；细菌进入胃肠道影响其微生态平衡，胃肠道功能弱的老人及生活方式不健康者更易受胃肠道不适等问题。
起床后口腔经过一夜的代谢，会有大量细菌滋生，比如链球菌等。如果不刷牙直接喝水，水中可能会携带一些物质，但更关键的是口腔内的细菌可能会随着喝水的动作进入胃肠道等部位。有研究表明，口腔中的细菌种类繁多，一晚上的时间足够细菌数量增加，不刷牙就喝水会让这些细菌有机会进入体内环境，虽然不一定立刻引发疾病，但长期如此可能增加胃肠道感染等风险的潜在因素。对于儿童来说，他们的口腔自洁能力相对较弱，一晚上口腔内细菌积累情况可能更明显，不刷牙就喝水更容易让细菌进入体内，对儿童的健康发育可能产生潜在不良影响。
牙齿健康影响
牙齿表面在睡眠过程中会有食物残渣残留，尤其是夜间如果有进食行为，食物残渣在口腔内经过唾液的部分消化后会附着在牙齿表面。不刷牙就喝水，水无法有效清洁牙齿表面的这些残留物质，时间久了，这些物质会与口腔中的酸性物质等发生反应，容易导致龋齿等牙齿问题。从年龄角度看，青少年处于牙齿发育的关键时期，牙齿矿化等过程还未完全稳定，不刷牙就喝水对牙齿健康的危害可能更为显著，因为他们的牙齿更容易受到外界不良因素的影响而出现龋齿等问题。
对胃肠道的初步影响
不刷牙就喝水，口腔中的细菌等物质进入胃肠道后，对于胃肠道的微生态环境有一定影响。正常胃肠道有自身的微生态平衡，口腔带入的细菌可能会打破这种平衡，尤其是对于胃肠道功能较弱的人群，比如老年人，他们的胃肠道蠕动功能可能下降，免疫系统功能也可能有所减退，不刷牙就喝水后细菌进入胃肠道更易引发胃肠道不适等问题。而对于生活方式不健康，比如经常熬夜等人群，本身身体的各项机能处于相对紊乱状态，不刷牙就喝水会进一步加重胃肠道微生态失衡的风险。
