多发性肝内胆管结石的形成与胆汁成分异常、胆道感染、胆汁淤积、胆道解剖结构异常及遗传代谢因素密切相关，这些因素共同作用导致胆汁中可溶性成分过饱和、细菌感染改变胆汁理化性质、胆汁排泄受阻等，最终形成结石。
胆汁成分异常：胆固醇结石占比高，与胆固醇代谢异常有关，女性因雌激素影响胆固醇溶解度，围绝经期后风险增加；胆红素结石与胆红素代谢异常相关，胆道感染时肠道细菌产生β-葡萄糖醛酸苷酶，分解结合胆红素为游离胆红素，形成结石，多见于中老年及有胆道手术史者。
胆道感染：细菌感染改变胆汁成分，如大肠杆菌产生内毒素影响胆汁pH值，促进胆红素钙盐沉积；厌氧菌感染可能增加结石形成风险，儿童因免疫系统发育不完善，胆道感染风险相对较低，但先天性胆道闭锁未及时治疗者易继发感染形成结石。
胆汁淤积：胆道梗阻（如胆道狭窄、肿瘤压迫）或胆汁排泄通路不畅导致胆汁滞留，长期淤积使胆汁中胆固醇、胆红素等成分过饱和；长期禁食、缺乏运动的人群胆汁流动减慢增加淤积风险，老年患者因胃肠动力减弱、长期卧床更易出现胆汁淤积。
胆道解剖异常及遗传因素：先天性胆道结构异常（如胆管扩张症、肝内胆管节段性狭窄）导致胆汁引流不畅；家族性高胆固醇血症患者胆固醇代谢异常风险较高，20%~30%肝内胆管结石患者有家族遗传倾向，女性由于雌激素对胆红素代谢的影响，家族聚集性更明显。
特殊人群需注意：儿童应关注先天性胆道发育情况，定期筛查；女性围绝经期后需监测胆固醇代谢指标；中老年患者需控制基础疾病（如糖尿病、高脂血症），避免长期卧床；有胆道手术史者需定期复查胆道通畅性，减少感染诱因。
