性别认同障碍表现为自我认知上生理性别与内心认同性别不一致，行为上有服饰选择、活动参与与自身生理性别不符，情感态度上有对自身生理性别痛苦不满、社交倾向认同性别群体且排斥自身生理特征并试图改变。
一、自我认知层面表现
个体强烈且持久地认为自己的生理性别与内心所认同的性别不一致。例如，生理性别为男性但内心坚定认为自己应是女性，或生理性别为女性却坚信自己应为男性，这种自我认知的偏差是性别认同障碍的核心表现之一，通常从儿童或青少年早期即可初步显现，且会随年龄增长持续存在并强化。
二、行为表现层面表现
1.服饰行为：会出现与自身生理性别不符的服饰选择与行为模式。生理性别为男性的个体可能频繁穿着女性化服饰，如长裙、化妆等；生理性别为女性的个体可能偏好穿着男性化服饰，如工装、短发造型等，通过外在行为来试图符合内心认同的性别形象。
2.活动参与：倾向于参与与自身生理性别不符的活动。生理男性可能热衷于参与女性相关的活动，如舞蹈、烹饪等；生理女性可能更积极参与男性主导的活动，如体育竞技、机械操作等，以此来展现内心认同性别所对应的行为范畴。
三、情感态度层面表现
1.痛苦与不满情绪：对自身生理性别产生持续且强烈的痛苦、不满情绪，常因无法改变生理性别而陷入焦虑、抑郁等负面情绪中。例如，生理男性因自身男性体征明显而长期感到痛苦，渴望摆脱男性生理特征带来的困扰。
2.社交倾向：在社交互动中更倾向于与内心认同性别群体交往，对自身生理性别相关的社交圈子存在排斥感。比如，认同自己为女性的生理男性会更愿意与女性群体交流相处，而回避与男性群体的多数常规社交活动。
3.对生理特征的排斥：对自身生理性别相关的特征存在强烈排斥，如生理女性可能厌恶自己的乳房发育，生理男性可能抗拒自身的胡须生长等，会通过采取一些措施试图改变这些生理特征来符合内心认同的性别。
