肾结石会引发多种症状，包括肾区疼痛（可呈隐痛、胀痛或绞痛，肾绞痛典型且可放射）、腹痛（易与其他腹部疾病混淆）、血尿（有肉眼或镜下血尿且活动后加重）、排尿异常（尿频、尿急因结石刺激膀胱黏膜）、其他症状如恶心呕吐（肾绞痛反射性引起）、发热寒战（合并尿路感染时出现）、尿量改变（梗阻严重或缓解时及长期影响肾功能时出现），且不同人群症状表现有差异。
腹痛：部分患者可能表现为腹痛，容易与其他腹部疾病混淆，需注意鉴别。
血尿
肉眼血尿或镜下血尿：肾结石患者由于结石移动损伤肾盂、输尿管黏膜，导致黏膜出血，从而出现血尿。血尿可表现为肉眼可见的粉红色、洗肉水样尿液，也可能仅在显微镜下发现红细胞增多。一般来说，活动后血尿症状可能会加重，因为活动会促使结石进一步移动，加重对黏膜的损伤。例如，临床观察发现约80%的肾结石患者会出现不同程度的血尿。
排尿异常
尿频、尿急：如果结石刺激膀胱黏膜，可能会引起尿频、尿急症状，患者会频繁产生尿意，且难以控制排尿。这是因为结石刺激导致膀胱敏感性增高，出现膀胱刺激征。
其他症状
恶心、呕吐：肾绞痛发作时，疼痛较为剧烈，常可引起反射性的恶心、呕吐，患者可能会伴有恶心、呕吐不适，呕吐后疼痛症状可能不会立即缓解。这是由于内脏神经反射引起胃肠道反应。
发热、寒战：当肾结石合并尿路感染时，患者可能出现发热、寒战等全身感染症状，体温可升高，这是因为细菌感染导致机体出现炎症反应，身体启动免疫防御机制。例如，约10%-15%的肾结石患者可能会并发尿路感染，进而出现发热等症状。
尿量改变：如果结石导致尿路梗阻严重，可能会引起尿量减少；而在结石移动，梗阻缓解时，尿量可能会短时间增多。长期的尿路梗阻还可能影响肾功能，导致肾功能减退，进而出现尿量长期异常等表现。
不同年龄、性别、生活方式和病史的人群在肾结石症状表现上可能有一定差异。例如，儿童肾结石患者症状可能不典型，可能仅表现为哭闹、发热等；女性患者在妊娠期发生肾结石时，症状可能会因为孕期生理变化而有所不同；长期饮水少、饮食中高钙高草酸等成分摄入过多的人群，更容易出现肾结石相关症状；有泌尿系统基础疾病如输尿管狭窄等病史的人群，发生肾结石后症状可能更严重或更复杂。
