化学阉割有激素水平变化相关副作用，如雄激素水平先短暂升高后大幅下降致男女相应症状，代谢方面有血脂代谢异常增心血管疾病风险，心理精神方面有情绪改变如抑郁、认知功能可能受干扰，骨骼肌肉系统有骨密度降低增骨质疏松风险、肌肉质量下降力量减弱，老年人群和有基础疾病人群需特别关注，老年人群副作用更明显，有基础疾病人群副作用可能加重基础疾病病情。
激素水平变化相关：化学阉割主要通过药物抑制雄激素的分泌或作用来实现。在这个过程中，体内雄激素水平会显著降低。例如使用黄体生成素释放激素类似物（LHRHa），初期可能会因为药物刺激使雄激素短暂性升高，随后长期使用会导致雄激素水平大幅下降。男性会出现性欲减退、阴茎勃起功能障碍等情况，女性可能会出现雌激素水平相对失衡相关的症状，如潮热、阴道干涩等。这是因为雄激素对维持正常的性欲和生殖系统功能有着重要作用，雄激素水平的大幅波动打乱了内分泌的平衡状态。
代谢方面影响：雄激素对代谢有一定的调节作用，雄激素水平降低可能会引起代谢改变。有研究发现，接受化学阉割的个体可能会出现血脂代谢异常，表现为胆固醇、甘油三酯等指标的变化，增加心血管疾病的潜在风险。这是由于雄激素参与了脂肪代谢的调节，雄激素水平的降低干扰了正常的脂肪代谢途径。
心理精神方面副作用
情绪改变：很多接受化学阉割的个体可能会出现情绪方面的问题，如抑郁情绪。因为雄激素与大脑的神经递质调节等有一定关联，雄激素水平的大幅变化可能影响神经递质的平衡，进而导致情绪低落、兴趣减退等抑郁症状。有临床观察发现，部分患者在开始化学阉割治疗后，会逐渐出现情绪持续低落的情况，且这种情绪改变可能会对患者的日常生活和心理状态产生较大影响。
认知功能影响：有研究提示，雄激素对认知功能有一定的影响，化学阉割导致雄激素水平降低可能会对认知功能产生一定干扰。例如可能会出现记忆力减退、注意力不集中等情况。不过目前相关研究还在进一步深入，不同个体之间可能存在差异，但这种潜在的认知功能方面的影响也是化学阉割需要关注的副作用之一。
骨骼肌肉系统副作用
骨密度变化：雄激素对维持骨骼健康有重要作用，雄激素水平降低会影响骨代谢。长期化学阉割可能会导致骨密度降低，增加骨质疏松的发生风险。男性患者可能会出现骨骼疼痛等症状，女性患者同样面临骨质疏松相关的风险，尤其是绝经后的女性在接受化学阉割时，骨密度下降的风险可能会进一步增加。这是因为雄激素有助于促进成骨细胞的活性，维持骨量，雄激素水平降低后，破骨细胞相对活跃，骨吸收增加，骨形成减少，从而导致骨密度降低。
肌肉质量改变：雄激素对肌肉的生长和维持也有作用，雄激素水平降低可能会引起肌肉质量下降、肌肉力量减弱。男性患者可能会感觉到肌肉变得松弛，力量不如以前，女性患者也可能会出现肌肉功能相关的变化，这会影响患者的日常活动能力和生活质量。
特殊人群需特别关注的情况
老年人群：老年患者在接受化学阉割时，内分泌系统、代谢系统等本身就处于相对衰退的状态，化学阉割带来的雄激素水平变化等副作用可能会对他们产生更明显的影响。例如老年男性本身雄激素水平就较低，再经过化学阉割，内分泌平衡的波动可能会更剧烈，更容易出现心血管疾病等代谢相关并发症的风险升高情况；老年女性在雌激素本身有变化的情况下，化学阉割导致的雌激素相对失衡等问题可能会更突出，如潮热等症状可能会更严重，且骨质疏松的风险可能进一步加大。
有基础疾病人群：对于本身患有心血管疾病、代谢性疾病（如糖尿病）、精神心理疾病等基础疾病的患者，化学阉割带来的副作用可能会加重基础疾病的病情。例如本身有心血管疾病的患者，化学阉割导致的血脂代谢异常可能会使心血管疾病的病情恶化；有糖尿病的患者，雄激素水平变化可能会影响血糖的代谢控制；有精神心理基础疾病的患者，化学阉割引起的情绪改变等副作用可能会导致基础精神心理疾病的复发或加重。所以这类患者在接受化学阉割前需要进行更全面的评估和谨慎的考虑，在治疗过程中要密切监测基础疾病的情况。
