小肠吸收不良综合征会引发多种疾病，主要包括营养不良性疾病、维生素缺乏症、电解质紊乱、感染风险增加及消化系统其他并发症等，严重影响患者营养状态和全身健康。
一、营养不良相关疾病。长期营养吸收障碍导致蛋白质摄入不足，引发低蛋白血症，表现为下肢或眼睑水肿、皮肤弹性下降；体重快速下降（每周＞1%），肌肉萎缩、乏力明显。儿童群体生长发育迟缓（身高体重低于同年龄标准第3百分位），青少年骨骼发育异常（骨龄落后）；老年患者易出现肌肉减少症，跌倒风险升高，甚至因呼吸肌萎缩引发呼吸功能下降。
二、维生素缺乏性疾病。维生素A吸收不足导致夜盲症、角膜干燥；儿童缺乏时免疫力下降，易患呼吸道感染。维生素D缺乏引发儿童佝偻病（颅骨软化、鸡胸），成人骨软化症（骨痛、肌无力）及骨质疏松，孕妇缺乏增加胎儿骨骼发育异常风险。维生素B族缺乏表现为维生素B1缺乏致脚气病（下肢麻木、水肿），B12缺乏引发巨幼细胞性贫血（面色苍白、舌炎），叶酸缺乏导致胎儿神经管畸形。维生素K缺乏时凝血功能障碍，皮肤黏膜易出血（如牙龈出血、皮下瘀斑）。
三、电解质与酸碱平衡紊乱。钠钾离子吸收障碍引发低钠血症（乏力、意识模糊）、低钾血症（心律失常、肌肉无力），尤其长期腹泻者更易发生。钙磷代谢异常导致低钙血症（手足抽搐、骨密度下降），儿童可能出现惊厥。代谢性酸中毒时患者呼吸深快、恶心呕吐，老年或慢性病患者可能诱发心脑血管意外。长期低钾还可能引发肾小管功能受损，影响肾脏浓缩功能。
四、感染风险增加。肠道菌群结构失衡（有益菌减少、致病菌定植），诱发慢性腹泻或急性胃肠炎（大肠杆菌、沙门氏菌感染）。免疫球蛋白合成不足导致呼吸道感染（肺炎、支气管炎）发生率升高，皮肤黏膜念珠菌感染（口腔、肛周）更常见。老年患者因免疫力低下，感染后病情进展快，易并发败血症；糖尿病患者合并感染时，伤口愈合延迟风险增加。
五、消化系统其他并发症。胆汁酸吸收障碍使肠道黏膜屏障功能下降，增加胆结石形成风险（胆汁淤积性结石）。胰腺分泌功能受影响，慢性胰腺炎发病率升高，表现为上腹痛、脂肪泻加重。儿童长期吸收不良可伴随肠黏膜萎缩，影响消化酶分泌，形成恶性循环。回肠末端吸收不良者易出现胆盐缺乏，导致脂肪泻加重，进一步降低脂溶性维生素吸收效率。
