晨起口臭可能由多种因素引起，包括口腔局部因素如清洁不彻底、龋齿、牙龈炎或牙周炎、智齿冠周炎；全身系统性疾病因素如消化系统疾病（胃食管反流病、消化不良）、呼吸系统疾病（鼻窦炎、扁桃体炎）、糖尿病；还有其他因素如药物因素、长期吸烟饮酒等。不同年龄人群受各因素影响的情况有所不同。
龋齿：牙齿上的龋洞内容易滞留食物碎屑，细菌在龋洞内滋生繁殖，分解食物产生异味。龋齿的发生与口腔卫生状况、饮食习惯等有关，儿童喜欢吃甜食且口腔清洁相对不彻底，较成年人更易患龋齿进而导致晨起口臭；老年人由于牙龈萎缩等原因，牙缝增大，食物残渣更易嵌塞在龋洞内，若不及时处理也会引发口臭问题。
牙龈炎或牙周炎：牙龈发炎时，牙龈组织充血、水肿，细菌及其代谢产物增多，会产生难闻气味。牙龈炎和牙周炎的发生与口腔卫生不良、菌斑堆积等因素相关，不同年龄段人群均可患病，儿童可能因口腔卫生意识不足导致菌斑堆积引发炎症；老年人则可能因全身健康状况改变、牙齿松动等因素增加患牙周炎的风险，从而出现晨起口臭。
智齿冠周炎：智齿萌出不全时，牙冠周围软组织发生炎症，局部会有红肿、疼痛，且容易积存食物残渣和细菌，产生异味。智齿冠周炎在青少年及成年人中较为常见，尤其在智齿萌出阶段，若口腔卫生维护不佳，就容易引发炎症导致口臭。
全身系统性疾病因素
消化系统疾病
胃食管反流病：胃酸反流至食管甚至口腔，可引起口臭。胃食管反流病的发生与食管下括约肌功能障碍、饮食习惯等有关，肥胖人群、老年人等相对更易患该病，不同年龄人群的发病机制可能受生活方式影响不同，例如，年轻人若经常暴饮暴食、进食过多高脂食物等，会增加胃食管反流的风险，进而导致晨起口臭。
消化不良：胃肠蠕动减慢，食物在胃肠道内停留时间过长，发酵产生异味，可通过食管反流至口腔引起口臭。消化不良在各年龄段均可能发生，儿童可能因饮食不规律、食用过多零食等导致消化不良；成年人工作压力大、饮食不规律等也易出现消化不良相关的晨起口臭问题。
呼吸系统疾病：如鼻窦炎、扁桃体炎等，鼻腔或咽喉部位的脓性分泌物会倒流至口腔，产生异味。鼻窦炎在儿童和成年人中均有发病，儿童可能因上呼吸道感染等引发鼻窦炎；成年人则可能因过敏、细菌感染等导致鼻窦炎，进而出现晨起口臭；扁桃体炎可发生于各个年龄段，儿童扁桃体相对较大，更容易受到病原体侵袭引发炎症，从而导致口臭。
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，体内酮体生成增加，可出现酮症口臭。糖尿病的发病与遗传、生活方式等多种因素有关，不同年龄段的糖尿病患者，其血糖控制情况受自身饮食、运动及治疗方案等影响，例如，老年糖尿病患者若合并其他慢性疾病，血糖控制往往更具挑战性，更容易出现酮症口臭等情况。
其他因素
药物因素：某些药物服用后可能会引起口干，从而导致晨起口臭，如一些降压药、抗抑郁药等。不同药物对不同人群的影响不同，老年人往往同时服用多种药物，药物之间的相互作用可能增加口干等不良反应的发生风险，进而导致口臭。
长期吸烟饮酒：吸烟会使牙齿表面残留烟渍，且烟草中的有害物质会影响口腔环境；饮酒后口腔黏膜处于相对干燥状态，且酒精代谢产物可能通过口腔散发气味，长期吸烟饮酒者晨起口臭的概率相对较高。不同年龄人群长期吸烟饮酒对口腔和全身健康的影响程度不同，年轻人长期吸烟饮酒可能会更早出现口腔及全身健康问题，老年人长期吸烟饮酒则会进一步加重已有的健康隐患，导致晨起口臭等情况更为明显。
