精子质量异常可能增加胚胎停育风险，但并非唯一原因，需结合母体情况综合判断。
精子DNA碎片率（DFI）过高是重要影响因素。研究显示，DFI＞30%时，胚胎停育风险升高2-3倍。精子DNA损伤会导致胚胎染色体结构异常，影响早期发育关键基因表达，增加胎停概率。
精子染色体异常可直接引发胚胎停育。临床数据表明，严重畸形精子症患者中，非整倍体精子（如21三体精子）比例显著升高，与胚胎染色体异常及胎停密切相关。Y染色体微缺失或染色体结构异常（如平衡易位）也可能通过精子遗传给胚胎。
精子活力低下影响胚胎质量。弱精症患者精子穿透卵子能力下降，受精成功率降低；即使受精，低活力精子提供的遗传物质完整性较差，可能导致胚胎发育潜能不足，增加胎停概率。WHO标准显示，前向运动精子＜32%时，胎停风险上升1.8倍。
高畸形精子率关联胚胎染色体异常。正常精子形态率＜4%的严重畸形精子症患者，其精子头部异常（如大头、小头）常伴随核DNA浓缩不良，导致胚胎染色体非整倍体风险增加。研究证实，畸形精子率＞96%时，胎停率可达25%-30%。
生活方式与疾病因素间接影响精子质量。长期吸烟、酗酒、肥胖或环境毒素暴露会损伤精子DNA；生殖道感染（如支原体、衣原体）、精索静脉曲张等疾病也会降低精子活力与完整性。建议特殊人群（如肥胖、慢性病患者）改善生活方式并接受规范治疗。
