大多数情况下，包皮环切手术安全性较高，后遗症发生率较低。但仍可能出现短期并发症如出血、感染，长期可能有瘢痕形成或功能影响，术后规范护理可显著降低风险。
一、短期术后并发症。术后24小时内可能出现少量出血，多因术中止血不彻底或术后剧烈活动导致；感染多与卫生清洁不足相关，表现为切口红肿、渗液；疼痛肿胀通常术后3-5天内明显，可通过冷敷或非甾体抗炎药缓解。出现异常出血或持续疼痛需及时就医。
二、瘢痕与外观问题。瘢痕形成与个体体质（如瘢痕体质者风险较高）、手术方式（传统环切术瘢痕相对明显）相关。多数轻度瘢痕不影响功能，仅外观轻微改变；严重瘢痕或切口裂开可能需二次修复。建议选择经验丰富医生以减少瘢痕风险。
三、性功能影响。现有研究显示，包皮环切术对勃起功能无长期负面影响，但部分患者术后早期可能因切口牵拉出现勃起疼痛，或短暂性敏感度变化，随切口愈合逐渐恢复。极少数患者可能因过度敏感焦虑影响性生活，需心理疏导或专业评估。
四、特殊人群注意事项。儿童需由儿科泌尿外科医生评估，6岁以下若无严重包茎不建议常规手术；青少年需关注心理预期管理，避免因外观焦虑影响恢复；老年患者合并糖尿病、高血压时需控制基础病后手术，优先选择微创术式以降低风险。
