巧克力囊肿的治疗需基于囊肿大小、症状、生育需求及年龄等因素个体化选择，常见方案包括定期观察、药物干预、手术治疗等，多数患者经规范管理可有效控制病情，改善症状与生活质量。
- 无症状或小囊肿的观察治疗：对于直径＜5cm、无明显症状（如痛经、盆腔疼痛、月经异常）的巧克力囊肿，通常建议每3-6个月进行超声复查，监测囊肿大小变化。若囊肿在随访中稳定增大（如每年增长＞1cm）或出现症状，需及时调整治疗方案，期间应避免剧烈运动及过度刺激盆腔以降低囊肿扭转、破裂风险。
- 有症状或较大囊肿的药物治疗：存在明显痛经、非经期盆腔疼痛或囊肿直径≥5cm时，可采用药物干预。一线药物为激素类制剂（如口服短效避孕药、促性腺激素释放激素激动剂），可通过调节激素水平抑制内膜异位组织生长、缩小囊肿体积，缓解疼痛症状。用药期间需注意月经周期变化、乳房胀痛、头痛等副作用，用药时长通常不超过6个月，需定期监测肝肾功能及激素水平。
- 需手术治疗的情况：当囊肿持续增大（每年增长＞2cm）、药物治疗效果不佳、超声提示囊肿内壁不规则或怀疑恶性病变时，应考虑手术干预。手术方式包括腹腔镜下囊肿剥除术（适用于有生育需求者，术后妊娠率约50%-70%）及开腹手术（适用于粘连严重或疑似恶性病变者）。无生育需求且症状严重者可选择全子宫+双侧附件切除术，但需谨慎平衡根治与卵巢功能保留的关系，术后复发率约1%-5%。
- 特殊人群的治疗策略：备孕女性建议优先腹腔镜手术剥除囊肿，术后3-6个月内自然受孕，以避免囊肿复发对生育功能的影响；绝经后女性若无明显症状且囊肿稳定（直径＜4cm）可继续观察，若囊肿增大合并阴道出血或CA125升高，需手术探查排除卵巢癌；合并糖尿病、高血压等基础疾病者，需在控制基础疾病稳定后评估手术风险，优先选择创伤小的腹腔镜手术，术后加强伤口护理预防感染。
- 低龄女性与儿童的特殊注意：巧克力囊肿罕见于青春期前女性，若确诊需重点排除血液系统疾病及先天性卵巢发育异常，确诊后优先采用激素类药物（如甲羟孕酮）短期干预，以避免长期大剂量用药对骨骼发育的影响，手术仅适用于囊肿破裂导致急腹症或药物无效的情况，尽量保留卵巢功能以保障成年后生育能力。
