阴茎发育相对较小可能由遗传因素致家族有相关倾向影响胎儿生殖系统发育、内分泌因素中雄激素缺乏或其他内分泌问题、胚胎发育关键期受不良因素干扰、肥胖致雄激素与雌激素比例失衡、疾病因素如尿道下裂等先天性尿道畸形或睾丸疾病等引起，若发现阴茎明显小于同龄人正常范围应及时就医全面检查明确原因并采取相应干预措施，有相关疾病因素要积极治疗原发病改善阴茎发育状况。
若家族中有相关遗传倾向，可能导致阴茎发育相对较小。遗传基因会影响胎儿在母体发育过程中生殖系统的生长发育情况，例如某些与性激素受体、激素合成相关的基因发生突变或异常表达，可能干扰阴茎的正常发育进程。这种情况往往从出生时就可能呈现出阴茎较小的特征，且具有一定的家族聚集性。
内分泌因素
雄激素缺乏：
胎儿时期或出生后如果雄激素分泌不足，会影响阴茎的发育。雄激素在阴茎发育中起着关键作用，它能促使阴茎海绵体等组织的生长和分化。例如，先天性肾上腺皮质增生症等疾病可能导致雄激素合成障碍，使得体内雄激素水平低下，从而影响阴茎的正常发育，表现为阴茎较小。一般在儿童期就可能发现阴茎发育迟缓、较小的情况。
青春期是阴茎发育的重要阶段，若青春期雄激素分泌不足，也会影响阴茎的进一步发育。青春期雄激素水平下降可能与垂体疾病、睾丸疾病等有关，如垂体肿瘤导致促性腺激素分泌减少，进而影响睾丸分泌雄激素，使得阴茎发育受影响。
其他内分泌相关问题：甲状腺功能减退等内分泌疾病也可能间接影响阴茎发育。甲状腺激素对机体的生长发育包括生殖系统的发育有调节作用，甲状腺功能减退时，机体代谢减缓，可能影响包括阴茎在内的多个器官的正常生长发育进程。
胚胎发育异常
在胚胎发育的关键时期，如孕早期受到某些不良因素影响，可能导致阴茎发育异常偏小。例如，孕早期孕妇接触放射性物质、某些致畸药物等，这些因素可能干扰胚胎生殖系统的正常分化和发育，使得阴茎在胚胎期就没有正常发育到应有的大小。
肥胖因素
肥胖儿童可能存在体内雌激素水平相对升高的情况，雄激素与雌激素的比例失衡会影响阴茎发育。肥胖导致的内分泌紊乱，使得雄激素的作用受到一定抑制，同时脂肪组织中的芳香化酶会将雄激素转化为雌激素，进一步降低雄激素水平，从而影响阴茎的正常生长。一般肥胖儿童可能在青春期前就可观察到阴茎相对较小的情况，且随着肥胖程度加重，这种影响可能更明显。
疾病因素
尿道下裂等先天性尿道畸形：尿道下裂是常见的先天性尿道畸形，除了尿道开口异常外，往往还伴有阴茎发育偏小的情况。这是因为胚胎发育过程中尿道沟融合等环节出现异常，同时影响了阴茎海绵体等结构的正常发育，导致阴茎形态异常且较小。
睾丸疾病：隐睾症患儿如果没有及时治疗，睾丸长期处于不正常的位置（如腹腔内），由于腹腔温度高于阴囊温度，会影响睾丸的生精功能和内分泌功能，导致雄激素分泌不足，进而影响阴茎发育，使阴茎较小。另外，睾丸发育不良等疾病也会导致雄激素分泌减少，影响阴茎发育。
如果发现阴茎明显小于同龄人正常范围，建议及时就医，进行全面的检查，包括性激素水平检测、染色体检查、影像学检查等，以明确具体原因，并采取相应的干预措施（如针对内分泌因素进行相应激素补充等，但需严格遵循医疗规范进行）。同时，对于有相关疾病因素的情况，要积极治疗原发病来改善阴茎发育状况。
