小儿川崎病病因尚未完全明确，目前认为是感染、免疫、遗传及环境因素共同作用的结果，其中感染可能触发免疫异常，遗传易感性增加发病风险，环境因素也可能参与调节。
感染因素：川崎病好发于秋冬或春夏交替季节，可能与病毒（如EB病毒、腺病毒）、细菌（如链球菌）等病原体感染有关，这些病原体可能通过激活免疫系统触发血管炎症反应，但具体致病病原体尚未明确，仅为潜在触发因素。
免疫因素：川崎病属于自身免疫性血管炎，免疫系统过度激活后攻击血管内皮细胞，导致血管炎症、发热、皮疹等症状，T细胞、细胞因子（如IL-6、TNF-α）在其中起关键作用，免疫紊乱是发病的核心机制之一。
遗传易感性：部分研究显示川崎病存在家族聚集倾向，HLA-B51基因等特定基因多态性可能增加患病风险，但遗传因素并非单一决定因素，需结合环境暴露等共同作用，且不同种族人群的基因关联存在差异。
环境因素：生活环境中的空气污染物、二手烟暴露可能影响血管内皮功能，气候变化（如温差大）或维生素D缺乏等营养因素可能通过影响免疫状态间接增加发病几率，低龄儿童、长期暴露于污染环境的人群风险相对较高。
