胎儿亲子鉴定根据检查方式不同，可在不同孕周进行：有创检查（绒毛取样、羊水穿刺）分别在孕10-13周、16-22周左右开展；无创胎儿亲子鉴定可在孕7周及以后进行，越早检测胎儿游离DNA浓度越高，准确率越稳定。
一、绒毛取样（孕10-13周）：孕10周后胎盘绒毛组织已发育成熟，超声引导下采集胎盘绒毛细胞，能获取稳定遗传物质，样本检测准确率达99.9%。但需在孕10周后操作，此时绒毛量充足且胎盘结构稳定，可降低流产风险至0.5%-1%。若孕10周前采样，绒毛组织量不足；孕13周后胎盘绒毛可能因母体挤压导致样本质量下降，需结合孕妇凝血功能、胎盘位置综合评估。
二、羊水穿刺（孕16-22周）：孕16周后羊水量达200-300ml，胎儿脱落细胞浓度高，检测准确率超99.9%。超声定位下避开胎盘附着处及胎儿，抽取羊水时需严格无菌操作，术后观察24小时以防感染。该方式流产风险约0.3%-0.5%，低于绒毛取样，适合孕中期且无流产史、凝血功能正常的孕妇。
三、无创胎儿亲子鉴定（孕7周及以后）：通过采集孕妇外周血（5-10ml），利用高通量测序分离胎儿游离DNA，孕7周后母血中胎儿游离DNA占比达3%-6%，随孕周增加持续上升，孕12周后浓度更稳定，准确率与有创检查相当。无需侵入性操作，流产风险为0，适合高龄（35岁以上）、有流产史或对有创检查顾虑的孕妇。
四、特殊情况注意事项：若孕妇有染色体异常（如唐氏筛查高风险），需先完成产前诊断再进行亲子鉴定，避免干扰结果；羊水穿刺术后若样本污染，需48小时内重新采样，否则影响准确性；所有检测需在正规医疗机构进行，术前需沟通孕周、病史及风险，术后注意休息，避免剧烈活动。
