婴儿肠炎的常见症状包括腹泻、呕吐、腹痛、发热及脱水相关表现，具体特征因年龄、感染类型及个体差异有所不同。
- 腹泻：表现为大便次数显著增多（通常每日超过3次，母乳喂养婴儿每日可达6-8次以上），性状改变（轮状病毒感染多为黄色水样便，诺如病毒感染常伴黏液，细菌感染可能出现黏液脓血便），部分患儿大便有酸臭味或腥臭味。新生儿及早产儿腹泻症状更隐匿，常表现为喂养困难、排便次数增加，严重时可因排便刺激肛周皮肤出现红肿。
- 呕吐：多为频繁呕吐（每日3次以上），呕吐物可能为奶液、黄绿色胆汁或未消化食物，严重者呈喷射状。婴幼儿（6个月~2岁）感染诺如病毒或细菌时，呕吐常与进食相关，进食后1~2小时内出现；先天性幽门狭窄患儿呕吐物为奶液且无胆汁，但婴儿肠炎伴发呕吐时需与生理性溢奶区分。
- 腹痛：婴儿无法自主表达疼痛，常表现为剧烈哭闹、蜷缩体位、双腿屈曲，轻触腹部时哭闹加剧或拒按。病毒感染性肠炎腹痛较轻，多为间歇性；细菌感染或寄生虫感染（如贾第虫）常伴持续性腹痛，可在夜间加重。
- 发热：体温波动范围较大，病毒感染多为低热（37.5~38.5℃），持续1~3天；细菌感染（如沙门菌、大肠杆菌）常出现高热（≥38.5℃），伴寒战。早产儿及免疫功能低下患儿可能仅表现为低热或体温不升，需警惕感染扩散风险。
- 脱水及全身症状：轻度脱水表现为尿量减少（婴儿每日尿量＜400ml）、口唇干燥、皮肤弹性尚可；中度脱水可见眼窝凹陷、前囟凹陷、哭时泪少；重度脱水可出现精神萎靡、四肢冰凉、血压下降。其他表现包括食欲锐减、腹胀、呼吸急促（代谢性酸中毒），母乳喂养婴儿可能因乳糖不耐受加重腹泻，混合喂养患儿易因电解质丢失出现手足抽搐。
