氟尿嘧啶可引发多种反应，包括血液系统反应（儿童易现白细胞下降，老年可能反应更重）、消化系统反应（常见恶心呕吐，有胃肠道基础病者更明显，还可致口腔黏膜炎，长期烟酒者更易发生）、皮肤反应（手足综合征随用药时间延长概率增加，糖尿病患者症状可能加重，部分患者会脱发）、神经系统反应（少数有中枢神经症状，有神经系统基础病者风险升高）、其他反应（大剂量或长期用可致心脏毒性，本身有心脏基础病者需谨慎，长期或大剂量用可损害肝肾功能，老年患者风险更高）。
消化系统反应
恶心、呕吐：较为常见，这是由于氟尿嘧啶刺激胃肠道黏膜，引起胃肠道蠕动和消化功能紊乱所致。多数患者在用药后可能会出现不同程度的恶心，部分患者会进而发展为呕吐，严重的恶心呕吐可能会影响患者的营养摄入和生活质量。对于有胃肠道基础疾病的患者，如慢性胃炎、胃溃疡等，使用氟尿嘧啶后消化系统反应可能会更明显。
口腔黏膜炎：氟尿嘧啶可能导致口腔黏膜出现炎症反应，表现为口腔黏膜充血、溃疡、疼痛等。这是因为氟尿嘧啶在体内代谢过程中产生的某些物质会对口腔黏膜细胞产生损伤作用。长期吸烟、饮酒的患者，口腔黏膜本身处于相对脆弱的状态，使用氟尿嘧啶后发生口腔黏膜炎的可能性增加。
皮肤反应
手足综合征：表现为手掌和足底出现感觉异常、红斑、肿胀、脱屑等。其发生机制可能与氟尿嘧啶干扰了皮肤细胞的正常代谢有关。在接受氟尿嘧啶治疗的患者中，一定比例会出现手足综合征，且随着用药时间的延长，发生的概率可能会增加。对于糖尿病患者，由于其本身存在外周神经病变等基础情况，使用氟尿嘧啶后手足综合征的症状可能会加重，因为糖尿病患者的神经和血管功能可能影响皮肤对药物的耐受性和修复能力。
脱发：部分患者在使用氟尿嘧啶后会出现脱发现象，这是因为氟尿嘧啶影响了毛囊细胞的生长和代谢。女性患者可能会因为脱发而产生较大的心理压力，影响其治疗的依从性和生活质量。
神经系统反应
少数患者可能出现中枢神经系统症状，如头痛、眩晕等。这可能是由于氟尿嘧啶通过血-脑屏障影响了中枢神经系统的神经递质平衡或神经细胞的功能。对于有神经系统基础疾病的患者，如脑血管疾病、癫痫等，使用氟尿嘧啶后神经系统反应的风险可能会升高，需要密切监测神经系统症状的变化。
其他反应
心脏毒性：大剂量或长期使用氟尿嘧啶可能会对心脏产生一定毒性，表现为心律失常、心肌缺血等。虽然其发生概率相对较低，但对于本身有心脏基础疾病的患者，如冠心病、心肌病等，使用氟尿嘧啶时需要谨慎评估心脏毒性的风险，因为基础心脏疾病可能会加重氟尿嘧啶对心脏的不良影响。
肝肾功能损害：氟尿嘧啶主要通过肝脏代谢和肾脏排泄，长期或大剂量使用可能会对肝肾功能造成一定损害，表现为肝功能指标如转氨酶升高等，肾功能指标如肌酐升高等。老年患者由于肝肾功能本身逐渐衰退，使用氟尿嘧啶后发生肝肾功能损害的风险可能较年轻患者更高，在用药过程中需要密切监测肝肾功能指标。
