再生障碍性贫血最主要的诊断依据是全血细胞减少（红细胞、白细胞、血小板均降低），骨髓造血组织显著减少、造血功能衰竭，且无明显肝脾淋巴结肿大。
骨髓穿刺与活检：骨髓穿刺涂片显示多部位骨髓增生重度减低，造血细胞（粒系、红系、巨核系）显著减少，非造血细胞（淋巴细胞、浆细胞、脂肪细胞等）比例增高。骨髓活检可进一步证实造血组织面积显著缩小，脂肪化明显。
血常规检查：外周血呈现全血细胞减少特征，红细胞计数、血红蛋白浓度降低，网织红细胞绝对值明显减少；白细胞总数及中性粒细胞比例降低，淋巴细胞比例相对增高；血小板计数显著降低。
排除其他疾病：需排除阵发性睡眠性血红蛋白尿（PNH）、骨髓增生异常综合征（MDS）、急性白血病、自身免疫性疾病等可能导致全血细胞减少的疾病。通过酸溶血试验、流式细胞术、染色体检查等可明确鉴别。
特殊人群注意事项：老年患者需警惕骨髓微环境退化，儿童患者若伴随生长发育迟缓需排查先天性骨髓衰竭综合征；孕妇因血容量增加可能掩盖血小板减少，需动态监测血常规变化；有放化疗史或长期接触化学毒物者，应追溯病史并评估骨髓损伤程度。
