手足口病由多种肠道病毒引起，常见的有肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）及其他肠道病毒，EV71易致重症，CoxA16一般病情较轻，其他肠道病毒致重症比例低，婴幼儿易发展为重症，要避免儿童密切接触患儿，保持良好卫生习惯，有接触史儿童需加强监测，出现症状及时就医。
柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）：CoxA16也是引起手足口病的常见病原体，主要引起手部、足部、口腔等部位的疱疹性损害，一般病情相对较轻，但也有个别重症情况报道，该病毒感染在学龄前儿童中较为常见，传播途径主要通过密切接触、飞沫传播等。
其他肠道病毒：其他一些肠道病毒如柯萨奇病毒A组的其他型别（如CoxA2、CoxA4等）、柯萨奇病毒B组以及埃可病毒等也可引起手足口病，但相对EV71和CoxA16来说，引起重症的比例较低。例如柯萨奇病毒A组其他型别引起的病例多以皮肤黏膜疱疹为主要表现，临床症状相对较轻，病程一般在1-2周左右可自愈。
对于不同年龄的儿童，尤其是婴幼儿，由于其免疫系统发育尚不完善，感染肠道病毒后更易发展为重症，需密切观察病情变化。在生活方式方面，应避免儿童与手足口病患儿密切接触，保持良好的个人卫生习惯如勤洗手等。对于有手足口病患儿接触史的儿童，要加强健康监测，一旦出现发热、口腔疱疹、手足皮疹等症状应及时就医。
