导致扁桃体发炎的具体原因主要包括病毒感染（如腺病毒、流感病毒）、细菌感染（以A组β溶血性链球菌最常见）、免疫力下降时病原体入侵，以及局部刺激或慢性炎症（如吸烟、过敏、扁桃体隐窝堵塞）。
- 病毒感染：儿童和青少年更易因腺病毒、EB病毒感染引发扁桃体炎，表现为急性发作，常伴随鼻塞、流涕等上呼吸道症状。免疫力较弱的老年人感染流感病毒后也可能诱发扁桃体炎症。
- 细菌感染：链球菌感染多见于学龄期儿童及青年，典型症状为高热、咽痛剧烈，扁桃体表面可见脓性分泌物。若不及时治疗，可能引发风湿热、肾炎等并发症，需尽早使用抗生素干预。
- 免疫力因素：长期熬夜、过度劳累或营养不良会降低机体抵抗力，使扁桃体隐窝内的正常菌群或入侵病原体大量繁殖。扁桃体隐窝较深者易积存食物残渣，成为细菌滋生的温床，尤其在秋冬季节干燥时更易发作。
- 局部刺激：长期吸烟、接触二手烟或空气污染会反复刺激扁桃体黏膜，导致慢性充血、增生。过敏性鼻炎患者因长期鼻塞张口呼吸，扁桃体长期暴露于干燥空气中，易引发炎症。
- 特殊人群注意：婴幼儿扁桃体未完全发育，免疫系统尚不完善，扁桃体炎多由病毒引起，需避免滥用抗生素；孕妇因激素变化及免疫力波动，易诱发扁桃体炎症，建议优先采用温盐水漱口等非药物方式缓解症状；糖尿病患者血糖控制不佳时，扁桃体炎易反复发作且愈合缓慢，需严格监测血糖。
