儿童抽动症的发生与遗传、神经生物学、心理、环境等多种因素相关。遗传因素使家族中有患者的儿童发病风险高；神经生物学因素包括神经递质失衡和大脑结构功能异常；心理因素涉及应激事件和性格特点；环境因素包含围生期因素和感染因素，这些因素均可能引发或加重儿童抽动症。
神经生物学因素
神经递质失衡：多巴胺、去甲肾上腺素、5-羟色胺等神经递质在儿童的神经调节中起着重要作用。当这些神经递质出现失衡时，可能引发抽动症。例如，多巴胺功能亢进假说认为，纹状体多巴胺活动过度或突触后多巴胺受体超敏可能导致抽动症的发生。研究发现，抽动症儿童脑内纹状体部位的多巴胺代谢产物水平与正常儿童存在差异，提示多巴胺系统功能异常参与了抽动症的发病过程。
大脑结构和功能异常：影像学研究显示，抽动症儿童的大脑某些区域存在结构和功能的改变。如额叶、基底节等区域的体积、灰质密度及神经连接等方面与正常儿童不同。基底节是调节运动的重要脑区，其功能异常可能影响运动控制，导致抽动症状的出现；额叶在认知、情绪调节等方面发挥作用，额叶功能异常可能与抽动症伴随的一些行为问题相关。
心理因素
应激事件：儿童在成长过程中经历的应激事件可能诱发或加重抽动症。例如，长期处于家庭关系紧张（如父母频繁争吵、离异等）、学习压力过大（如学业成绩长期不理想、考试焦虑等）、遭受重大生活事件（如亲人离世、严重受惊吓等）的儿童，其体内的应激激素水平会发生变化，影响神经系统的调节，从而增加抽动症的发病风险或导致症状加重。
性格特点：具有内向、敏感、情绪不稳定等性格特点的儿童相对更容易患抽动症。这类儿童在面对外界刺激时，情绪调节能力较差，更容易出现心理应激反应，进而影响神经内分泌和神经系统的平衡，引发抽动症状。
环境因素
围生期因素：母亲孕期的一些不良因素可能影响胎儿神经系统的发育，增加儿童患抽动症的概率。例如，母亲孕期感染、中毒、接触有害物质、吸烟、饮酒等，都可能对胎儿的大脑发育产生不利影响，导致神经系统发育异常，为抽动症的发生埋下隐患。
感染因素：某些感染性疾病也与儿童抽动症的发病有关。例如，链球菌感染后可能引发自身免疫反应，这种免疫反应可能累及神经系统，导致抽动症的发生，即所谓的小儿自身免疫性神经精神障碍伴链球菌感染（PANDAS）综合征。研究发现，在抽动症儿童中，链球菌感染的检出率相对较高，且在感染控制后部分患儿的抽动症状可得到改善。
