深海恐惧症通常能治疗，治疗方法为药物治疗、认知行为疗法、暴露疗法等。
1.药物治疗
症状严重且单纯心理治疗效果不佳时，在医生指导下使用硝西泮、阿普唑仑等抗焦虑药缓解焦虑、紧张情绪，帮助患者更好配合心理治疗；也可能使用抗抑郁药调节大脑神经递质，改善情绪状态，增强应对恐惧能力。
2.认知行为疗法
治疗师帮助患者识别和挑战恐惧相关负面认知，如认为深海充满未知危险会被怪物袭击等不合理想法，通过提供科学知识、分析恐惧不合理性，引导重建对深海正确认知。采用系统脱敏或暴露疗法，让患者逐步面对引发恐惧的深海相关刺激，从观看图片、视频开始，逐渐过渡到观看纪录片、去水族馆，学习放松技巧缓解恐惧反应。
3.暴露疗法
想象暴露时，治疗师引导患者在脑海中想象处于深海场景，描述细节，让患者在想象中逐渐适应恐惧；实景暴露则在安全保障下，让患者逐渐接触真实深海相关环境，如站在浅海边缘、参与潜水体验课程，每次暴露时间和深度逐步增加，帮助克服恐惧。
