甲癣由皮肤癣菌等真菌感染引起可致指甲凹凸等改变且具传染性，营养不良因缺乏营养素或营养吸收障碍会使指甲凹凸，外伤致脚趾甲母质受损会让新指甲凹凸，全身性疾病像皮肤病、糖尿病等会影响指甲生长致凹凸，部分人群因遗传因素易出现指甲凹凸不平情况。
一、甲癣（灰指甲）
由皮肤癣菌等真菌感染引起，真菌侵入甲板后，会破坏甲板的正常结构，导致指甲出现凹凸不平、增厚、变色等改变。研究表明，皮肤癣菌是引发甲癣的常见病原体，此类真菌感染具有传染性，可通过直接接触或共用物品传播。
二、营养不良
当人体缺乏维生素A、B族维生素、钙、铁等营养素时，会影响指甲的正常生长代谢。例如，缺乏维生素A会使指甲角质化异常；缺乏钙会导致指甲强度下降；饮食不均衡或患有胃肠道疾病、代谢性疾病等引起营养吸收障碍时，均可能出现指甲凹凸不平的现象。
三、外伤
脚趾受到挤压、碰撞、砸伤等外伤后，甲母质（指甲生长的重要结构）可能受损，新生长出的指甲会出现凹凸不平的情况，通常有明确的外伤史，且外伤后的指甲修复过程中易出现形态异常。
四、全身性疾病
某些全身性疾病可影响指甲生长，如银屑病、扁平苔藓等皮肤病，会累及甲床导致指甲形态改变；糖尿病患者因外周血管病变、神经病变等，可能影响指甲的血供和营养供应，进而出现指甲凹凸不平；外周血管疾病导致脚趾血液循环障碍时，也会干扰指甲正常生长，引发指甲异常。
五、遗传因素
部分人群可能存在遗传因素，天生指甲形态容易出现凹凸不平的情况，若家族中有类似指甲表现，遗传因素导致指甲形态异常的可能性增加。
