女性来大姨妈头痛受多种因素影响，激素变化时雌激素水平波动会致血管舒缩功能改变引发头痛，不同年龄段激素波动有差异；月经期间子宫内膜释放的前列腺素会作用于头部血管致头痛，不良生活方式会影响其平衡增加风险；神经递质如5-羟色胺代谢异常会干扰头部疼痛调控引发头痛，有偏头痛病史者更易触发；个体的体质、遗传及本身患有的其他疾病等个体差异因素也会影响来大姨妈时是否头痛及严重程度，如遗传使部分女性更敏感，患病女性生理变化会加重原有疾病对头部影响致头痛加重。
前列腺素作用因素
月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素。前列腺素除了会引起子宫平滑肌收缩，导致痛经外，还可能对头部血管产生作用。它能促使头部血管收缩或扩张，进而引发头痛。比如，过量的前列腺素会导致颅内血管张力变化，从而诱发头痛症状。不同生活方式的女性，前列腺素的合成和代谢可能有所不同，长期熬夜、饮食不规律等不良生活方式可能会影响前列腺素的平衡，增加来大姨妈头痛的发生风险。
神经递质影响因素
神经递质如5-羟色胺等在来大姨妈头痛中也起到一定作用。月经期间激素的变化会影响神经递质的代谢和功能。5-羟色胺是一种与头痛调节相关的神经递质，当它的代谢出现异常时，可能会导致头痛。例如，有研究表明，来大姨妈时5-羟色胺水平的波动可能干扰了神经系统对头部疼痛的调控，从而引发头痛。有偏头痛病史的女性，其神经递质系统本身可能存在一定的紊乱，在来大姨妈时，这种紊乱可能会被进一步触发，导致头痛更容易发生。
个体差异因素
个体的体质、遗传等因素也会影响来大姨妈时是否头痛以及头痛的严重程度。有些女性可能由于遗传因素，天生对月经期间体内激素、前列腺素等变化更为敏感，从而更容易出现头痛症状。而对于本身患有其他疾病的女性，如患有高血压、颈椎病等，来大姨妈时的生理变化可能会加重原有疾病对头部的影响，进而诱发或加重头痛。比如，患有颈椎病的女性，月经期间激素变化可能会影响颈部肌肉的紧张度，同时前列腺素等物质的作用可能会进一步刺激颈部神经，导致头痛症状加重。
