自身免疫性脑炎后遗症包括认知功能障碍、运动功能障碍、精神行为异常、癫痫发作等方面，不同方面受年龄因素和病史影响各有表现，如认知功能障碍有记忆力等问题及不同年龄和病史影响，运动功能障碍有肌张力等表现及不同年龄和病史影响，精神行为异常有情绪等表现及不同年龄和病史影响，癫痫发作有发作形式等表现及不同年龄和病史影响。
年龄因素影响：儿童患者可能在学习能力上受到明显影响，比如在学校里成绩下降，因为认知功能的异常会干扰其接受新知识和运用知识的能力；成年患者则可能在工作中出现效率降低，无法胜任原本熟悉的工作任务。
病史影响：有自身免疫性脑炎病史的患者，若病情控制不佳，认知功能障碍可能会逐渐加重，且不同的自身免疫性脑炎亚型可能对认知功能影响的侧重点有所不同。
运动功能障碍
表现：部分患者会出现运动障碍，如肌张力异常，可能表现为肌张力增高，肢体僵硬，活动不灵活；或者肌张力降低，肢体松软无力。还可能出现不自主运动，如震颤，表现为身体某部位不自主的抖动；舞蹈样动作，肢体出现无目的、快速的不规则运动等。
年龄因素影响：儿童患者运动功能障碍可能影响其大运动发育，如坐、站、走等能力的发展滞后，或者在精细运动方面，如抓握东西不灵活等；成年患者则可能影响其日常的行动能力，如行走不稳、穿衣、洗漱等精细动作困难。
病史影响：自身免疫性脑炎发病时的严重程度以及治疗过程等病史情况会影响运动功能障碍的程度，若发病时运动功能受累严重，后遗症期运动功能障碍可能更明显。
精神行为异常
表现：患者可能出现情绪方面的异常，如焦虑、抑郁，表现为情绪低落、对事物缺乏兴趣、容易紧张不安等；也可能有幻觉，如看到不存在的物体、听到不存在的声音等；还可能出现行为紊乱，如无目的的躁动、攻击性行为等。
年龄因素影响：儿童患者精神行为异常可能表现为性格改变，原本活泼的孩子变得孤僻、易怒等；成年患者则可能在社会交往和日常生活中的情绪、行为表现出与以往不同的异常状态。
病史影响：自身免疫性脑炎的病情严重程度以及治疗过程中使用药物等情况会影响精神行为异常的发生和严重程度，例如病情较重的患者可能更容易出现精神行为方面的后遗症。
癫痫发作
表现：部分自身免疫性脑炎后遗症患者会出现癫痫发作，发作形式多样，如全身性强直-阵挛发作，表现为突然意识丧失、全身抽搐、口吐白沫等；部分性发作，可表现为身体某一局部的抽搐等。
年龄因素影响：儿童癫痫发作可能对其生长发育产生较大影响，如影响大脑的进一步发育等；成年患者癫痫发作可能影响其生活质量和安全，例如在工作、出行等方面存在风险。
病史影响：自身免疫性脑炎发病时是否有癫痫发作以及发作的频率、严重程度等病史情况会影响后遗症中癫痫发作的发生情况，若发病时癫痫发作频繁，后遗症期癫痫发作的可能性相对较高。
