全身麻醉药有多种相关副作用，包括呼吸系统方面易致呼吸抑制，儿童和老年人更易受影响；心血管系统方面可引起血压下降，有基础疾病者风险更高；神经系统方面短期一般不致严重永久损害，但老年易现术后认知功能障碍，儿童需关注围术期变化，还可能有苏醒期躁动；肝肾功能方面正常剂量影响小，肝肾功能不全者用需谨慎；其他方面有胃肠道反应及个别过敏情况。
心血管系统相关副作用
全身麻醉药可对心血管系统产生影响，如引起血压下降。部分全身麻醉药会抑制心肌收缩力，扩张血管，从而导致血压降低。对于有心血管基础疾病的患者，如高血压、冠心病患者，使用全身麻醉药后血压波动可能会更大，增加心血管事件发生的风险。在儿童中，如果存在先天性心血管畸形等情况，使用全身麻醉药时对心血管系统的影响需要更谨慎评估，因为其自身心血管代偿能力相对较弱。老年人本身心血管调节功能下降，使用全身麻醉药后血压波动可能影响重要脏器的灌注。
神经系统相关副作用
短期使用全身麻醉药一般不会导致严重的永久性神经系统损害，但部分患者可能出现术后认知功能障碍，尤其在老年患者中相对常见，表现为记忆力减退、注意力不集中等。儿童神经系统处于快速发育阶段，虽然目前大量研究显示常规剂量、合理使用的全身麻醉药对儿童神经系统发育的长期影响尚不明确，但仍需密切关注其围术期神经系统的变化情况。另外，个别患者可能在麻醉苏醒过程中出现躁动等神经系统相关的表现。
肝肾功能相关副作用
大多数全身麻醉药主要通过肝脏代谢或肾脏排泄，但正常剂量下对肝肾功能的影响较小。然而，对于本身存在肝肾功能不全的患者，使用全身麻醉药时需要特别谨慎，因为药物的代谢和排泄可能会受到影响，进而加重肝肾功能的负担。例如，严重肝功能不全的患者，肝脏对全身麻醉药的代谢能力下降，可能导致药物在体内蓄积，增加副作用发生的风险；肾功能不全患者对通过肾脏排泄的全身麻醉药清除减慢，也可能引发一系列不良反应。
其他副作用
还可能出现恶心、呕吐等胃肠道反应，尤其是在麻醉苏醒期较为常见。对于有胃肠道疾病史的患者，如胃食管反流病患者，全身麻醉药引起的恶心、呕吐可能会加重反流风险，导致误吸等严重并发症。另外，个别人可能对全身麻醉药中的某些成分过敏，出现过敏反应，如皮疹、呼吸困难、血压下降等，这种情况虽然相对较少见，但一旦发生后果较为严重，需要麻醉医生在术前仔细评估患者的过敏史等情况。
