静脉全身麻醉存在多种副作用，呼吸系统相关有呼吸抑制（强效药大剂量或快速注射易致，老年、儿童更易受影响）和呼吸道梗阻（部分药致咽喉肌松，肥胖、颈部活动受限者风险高）；心血管系统相关有血压波动（丙泊酚致降、氯胺酮致升，需对特定患者谨慎）和心律失常（依托咪酯可引发，有基础心脏疾病者风险高）；其他副作用包括肝肾功能影响（长期或大剂量用可能影响，需评估患者肝肾功能）和术后恶心呕吐（常见，与多种因素有关，有高风险者需预防）。
呼吸抑制：静脉全身麻醉药物可能抑制呼吸中枢，导致呼吸频率减慢、潮气量降低。例如，一些强效静脉麻醉药如丙泊酚，在大剂量或快速注射时，容易引起呼吸抑制。对于老年患者，由于其呼吸功能本身有所减退，更容易出现呼吸抑制的情况；儿童在使用静脉全身麻醉时，也需要密切监测呼吸参数，因为儿童的呼吸调节功能相对不完善，呼吸抑制可能会对其造成更严重的影响，如导致低氧血症等。
呼吸道梗阻：部分静脉全身麻醉药物可能使患者的咽喉肌肉松弛，增加呼吸道梗阻的风险，尤其是肥胖患者、颈部活动受限患者等。肥胖患者本身气道解剖结构就存在一定异常，咽喉肌肉松弛后更易发生梗阻；颈部活动受限患者在肌肉松弛药物作用下，气道管理难度增加，发生梗阻的可能性也较高。
心血管系统相关副作用
血压波动：静脉麻醉药物可能影响心血管系统的稳定性，导致血压下降或升高。比如，丙泊酚可引起外周血管扩张，导致血压降低，对于本身存在低血压倾向或血容量不足的患者，这种血压下降可能更为明显；而氯胺酮可能会使血压升高、心率加快，对于有高血压病史的患者，使用氯胺酮进行静脉全身麻醉时需要特别谨慎，因为血压的剧烈波动可能会诱发心脑血管意外。
心律失常：某些静脉麻醉药物可能引发心律失常，如依托咪酯可能对心血管系统有一定刺激，导致心律失常的发生。有基础心脏疾病的患者，如冠心病、心律失常病史的患者，在使用静脉全身麻醉药物时，心律失常的发生风险相对更高，需要在麻醉前充分评估心脏状况，并在麻醉过程中密切监测心电图变化。
其他副作用
肝肾功能影响：大部分静脉麻醉药物经过肝脏代谢或肾脏排泄，长期或大剂量使用可能对肝肾功能产生一定影响。例如，部分药物在代谢过程中可能会加重肝脏的负担，对于已有肝肾功能不全的患者，这种影响可能更为显著。在麻醉前需要评估患者的肝肾功能状况，对于肝肾功能不全的患者，要选择对肝肾功能影响较小的麻醉药物，并调整用药剂量。
术后恶心呕吐：这是较为常见的静脉全身麻醉副作用之一，其发生机制较为复杂，可能与麻醉药物、手术刺激等多种因素有关。年轻患者相对老年患者可能发生术后恶心呕吐的概率有所不同，而且如果患者有既往术后恶心呕吐病史，再次进行静脉全身麻醉时发生的风险会更高。对于有术后恶心呕吐高风险的患者，可以在麻醉前采取一些预防措施，如使用预防性止吐药物等。
