检查用CT还是X光的决定因素包括病变部位与性质、患者因素、检查目的。病变部位与性质方面，骨骼系统骨折初步筛查选X光，复杂骨折等选CT；胸部肺部小结节等选CT；腹部胃肠道穿孔等选X光，实质器官病变选CT。患者因素中，儿童、孕妇、肾功能不全患者选择有不同考量。检查目的上，筛查性检查选X光，诊断性检查选CT。
骨骼系统：对于骨折的初步筛查，X光通常是首选，它能较为快速地显示骨骼的大致形态，看是否有明显的骨折线等情况。但如果是复杂骨折，比如涉及关节内的骨折或者需要更精细观察骨骼细微结构时，CT则更有优势，CT可以清晰地呈现骨骼的三维结构，有助于准确判断骨折的移位情况等。对于骨肿瘤等病变，CT能更好地显示肿瘤与周围骨骼的关系以及肿瘤内部的密度等情况，辅助判断肿瘤的性质。
胸部：胸部X光可用于初步观察肺部大致情况、心脏大小等，但对于肺部小结节、纵隔内病变等情况，CT的分辨率更高，能发现更小的病变以及更清晰地显示病变的细节，比如肺部小结节的形态、边缘等特征，有助于鉴别结节是良性还是恶性等。
腹部：对于胃肠道穿孔等急症，腹部X光有时可以看到膈下游离气体等征象。而对于腹部实质器官如肝脏、肾脏等的病变，CT能更清楚地显示器官的形态、大小以及有无占位性病变等，像肝脏肿瘤的检出和定性诊断方面，CT有较大优势。
患者因素
儿童：儿童对辐射较为敏感，在选择检查时需更谨慎。对于一些简单的骨骼问题，优先考虑X光，但如果病情需要更精准的诊断，如怀疑有复杂的脑部病变等，可能也会用到CT，但会严格控制辐射剂量。例如儿童头部外伤，若初步通过X光排查颅骨无明显骨折，但仍有疑似颅内病变时，会权衡利弊后选择合适的CT检查。
孕妇：孕妇一般尽量避免X光检查，因为X光的辐射可能会对胎儿造成不良影响。而CT的辐射剂量相对较高，更应谨慎，只有在病情非常必要时，经过严格评估后才会选择CT检查，并且会采取必要的防护措施保护胎儿。
肾功能不全患者：进行CT检查时若使用含碘对比剂，可能会增加对比剂肾病的风险，这类患者在选择CT检查时需要更加谨慎评估，必要时可能需要采取水化等措施来降低风险，而X光检查一般不受此影响。
检查目的
筛查性检查：如果是进行初步的大范围筛查，比如健康体检中的胸部初步检查等，X光可能更常用，因为其价格相对较低，辐射剂量相对也较低。
诊断性检查：当需要明确病变的详细情况，如病变的精确位置、与周围组织的关系等以进行准确诊断时，往往会选择CT检查。例如怀疑脑梗死的患者，早期头颅CT可以快速排除脑出血等情况，而对于脑梗死的进一步详细评估，可能需要结合头颅磁共振等，但CT在急性期的初步诊断中有重要作用。
