被尼帕病毒感染的症状主要包括前驱期表现、急性脑炎症候、呼吸系统损害、迟发型脑炎等。
1.前驱期表现
突发高热至39-40℃，伴持续性全脑胀痛，镇痛药难缓解。全身肌肉酸痛、极度乏力，部分以恶心、呕吐、腹痛等消化道症状为主，平均持续3-5天。
2.急性脑炎症候
病程第4-7天中枢神经受累，嗜睡最早出现，反应迟钝。有节段性肌阵挛，小脑受损则站立不稳、眼球震颤。病情恶化者突发抽搐，24小时内昏迷，瞳孔不等大提示脑疝。
3.呼吸系统损害
超半数病例有呼吸道症状，首发干咳、胸痛，影像学有肺炎表现。重症出现急性呼吸窘迫综合征，呼吸急促、发绀，常规氧疗无效。
4.迟发型脑炎
康复4个月至2年后病毒再激活，表现为认知功能衰退，记忆力、定向力受损，人格改变，难治性癫痫频发，复发期病死率高。
