尼帕病毒感染的主要表现包括全身症状、呼吸道症状、神经系统症状、消化道症状等。
1.全身症状
感染初期，患者常突发高热，体温迅速升至38℃以上，伴寒战或出汗，易被误诊为普通感冒。同时，全身肌肉酸痛明显，以背部、四肢和颈部为主，活动时加重，患者会感到极度乏力，活动耐力下降。
2.呼吸道症状
约三分之一患者早期出现轻度呼吸道症状，如干咳、咽部不适或胸闷，部分病例肺部听诊可闻及湿啰音。病情进展后，可能出现呼吸急促、低氧血症，严重者发展为急性呼吸窘迫综合征，需机械通气支持。
3.神经系统症状
多数患者发病后3—7天内症状快速进展，出现嗜睡、意识模糊、定向障碍等，部分患者癫痫发作、肢体无力、言语不清。严重脑炎可致昏迷、脑水肿，引发脑疝。
4.消化道症状
部分患者会出现恶心、呕吐等消化道不适，儿童病例呕吐更为常见，呕吐物多为胃内容物，严重时可能带有胆汁。
