尼帕病毒脑炎的症状主要有突发高热与剧烈头痛、难以控制的嗜睡、恶心呕吐、抽搐发作等，体征可能有脑膜刺激征阳性、病理反射引出、瞳孔异常等。
一.症状
1.突发高热与剧烈头痛
几乎所有患者都会出现急性高热，体温通常在三十九度以上，伴有寒战。头痛极为剧烈，呈持续性胀痛或跳痛，常规止痛药难以缓解，这是病毒引发颅内炎症的直接反应。
2.难以控制的嗜睡
患者会感到无法抗拒的困倦感，白天频繁打瞌睡，呼之能应但旋即入睡。这种嗜睡并非疲劳所致，而是大脑觉醒中枢受抑制的体现，随着病情加重会发展为昏睡甚至昏迷。
3.恶心呕吐
早期常出现喷射性呕吐，与饮食无关，吐后头痛不缓解。这是颅内压增高的典型表现，提示脑组织已发生水肿。
4.抽搐发作
患者可能经历全身或局部肌肉抽搐，表现为四肢强直抖动、双眼上翻，或仅面部口角抽动。发作时意识丧失，事后不能回忆。
二.体征
1.脑膜刺激征阳性
患者平卧时医生尝试屈颈，颈部僵硬抵抗下巴无法贴近胸口。克尼格征和布鲁津斯基征也呈阳性，这是脑膜炎的典型体征。
2.病理反射引出
当大脑皮层受损时，医生划足底外侧会出现拇趾背伸其余四趾扇形分开的巴彬斯基征阳性，提示锥体束受损。
3.瞳孔异常
瞳孔可能缩小或散大，对光反射迟钝或消失。两侧瞳孔不等大是脑疝形成的危险信号，需紧急抢救。
