导致尿毒症的原因包括原发性肾脏疾病中起病隐匿迁延的肾小球肾炎等致肾功减退，继发性的糖尿病肾病因长期高血糖损伤肾小球、高血压肾小动脉硬化因长期高血压破坏肾结构功能、自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮致肾炎症损伤，遗传性多囊肾因囊肿压迫肾实质，药物及毒物损伤如滥用肾毒性药物损害肾，尿路梗阻因结石等致尿液排出受阻破坏肾。
一、原发性肾脏疾病
原发性肾小球肾炎是导致尿毒症的常见原因之一，例如系膜增生性肾小球肾炎、膜性肾病等。这类疾病起病隐匿，病情长期迁延不愈，炎症持续损伤肾小球等肾脏结构，随着时间推移，肾脏功能逐渐减退，最终进展为尿毒症。
二、继发性肾脏疾病
1.糖尿病肾病：糖尿病患者若长期血糖控制不佳，高血糖状态会持续损伤肾小球基底膜及肾小球毛细血管，导致肾小球硬化等病变，随着病情进展，肾脏滤过功能逐步丧失，进而引发尿毒症。
2.高血压肾小动脉硬化：长期高血压使肾小球内囊压力增高，引起肾小球纤维化、肾小管萎缩，肾脏缺血缺氧，逐步破坏肾脏正常结构与功能，最终发展为尿毒症。
3.自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮，患者自身免疫系统攻击肾脏，引发肾脏炎症反应，长期的炎症损伤会破坏肾脏组织，导致肾功能进行性下降，最终发展为尿毒症。
三、遗传性肾病
例如多囊肾，这是一种遗传性疾病，肾脏内会出现多个囊肿，囊肿逐渐增大，压迫肾脏实质，破坏肾脏正常结构与功能，随着病情发展，肾脏功能逐渐减退，最终进展为尿毒症。
四、药物及毒物损伤
长期滥用肾毒性药物可损伤肾脏，如含马兜铃酸的中药，长期服用会损害肾小管间质，影响肾脏的正常代谢与排泄功能；某些抗生素（如氨基糖苷类抗生素）等使用不当也可能对肾脏造成损害，逐步影响肾脏功能，进而发展为尿毒症。
五、尿路梗阻
尿路结石、前列腺增生等疾病可导致尿路梗阻，使尿液排出受阻，肾脏产生的尿液无法顺利排出，引起梗阻性肾病。长期尿路梗阻会使肾脏内压力增高，破坏肾脏结构与功能，最终可进展为尿毒症。
