自身免疫性脑炎症状多样，包括精神行为异常（如情绪紊乱、认知功能障碍、行为异常等，儿童有其特殊性）、癫痫发作（各种类型，不同年龄表现有差异）、意识障碍（程度不同，老年患者预后受影响）、自主神经功能紊乱（如发热、多汗等，对有基础心血管病患者有影响）、语言障碍（语言表达和理解困难，儿童语言发育关键期出现影响大）、运动功能障碍（肌张力异常、肢体无力、共济失调等，老年患者影响日常生活自理能力）。
精神行为异常：患者可出现明显的精神症状，如情绪紊乱，表现为易激惹、焦虑、抑郁等；认知功能障碍，可出现记忆力减退、注意力不集中、计算力下降等；还可能出现行为异常，例如胡言乱语、重复刻板动作等。在儿童患者中，可能表现为学习成绩下降、性格改变等，这与儿童神经系统发育尚未完全成熟，自身免疫反应对神经系统的影响更为显著有关。
癫痫发作：是自身免疫性脑炎常见的症状之一。可表现为各种类型的癫痫发作，如全面性强直-阵挛发作（表现为突然意识丧失、全身抽搐）、部分性发作（可表现为身体某一局部的不自主抽动等）。自身免疫反应导致脑内神经细胞的异常放电，从而引发癫痫发作，不同年龄的患者癫痫发作的表现可能有所差异，成人与儿童的癫痫发作类型虽有一定共性，但儿童由于神经系统的特点，可能在发作频率、表现形式上有其特殊性。
意识障碍：患者可出现不同程度的意识障碍，从轻度的嗜睡到重度的昏迷均可出现。意识障碍的发生与自身免疫性脑炎导致的脑功能受损有关，炎症累及大脑皮层等重要结构，影响了大脑对意识的调控功能。在老年患者中，由于其基础健康状况相对较差，意识障碍可能会对其整体预后产生更严重的影响，恢复可能相对困难。
自主神经功能紊乱：可表现为发热、多汗、心动过速、血压波动等。自身免疫性炎症影响了自主神经中枢或自主神经纤维，导致自主神经功能失调。对于患有基础心血管疾病的患者，自主神经功能紊乱可能会加重心血管系统的负担，需要密切监测和关注，以避免出现严重的心血管事件。
语言障碍：部分患者会出现语言表达困难、理解障碍等语言方面的问题。这是因为语言中枢受到自身免疫性炎症的影响，导致语言相关的神经功能受损。在儿童语言发育关键期出现自身免疫性脑炎导致的语言障碍，可能会对其语言能力的正常发展造成长期影响，需要早期进行康复干预。
运动功能障碍：可出现肌张力异常，如肌张力增高或降低；还可能出现肢体无力、共济失调（表现为行走不稳、动作不协调等）。自身免疫性炎症累及锥体系、锥体外系等运动相关的神经结构，从而引起运动功能的异常。对于老年患者，运动功能障碍可能会影响其日常生活自理能力，需要加强护理和康复训练来提高生活质量。
