灵芝孢子粉不适宜人包括对其成分过敏者、处于急性病发作期人群、孕妇及哺乳期女性、肝肾功能不全者和婴幼儿。
对灵芝孢子粉中成分(如灵芝多糖、三萜类化合物)过敏者,服用后可能引发皮疹、瘙痒甚至过敏性休克,需严格避免使用。处于急性感染如肺炎、急性肠胃炎发作期人群,身体需集中精力对抗病原体,此时服用可能干扰免疫调节功能,延缓康复。孕妇及哺乳期女性因缺乏足够临床数据验证安全性,为避免潜在风险,不建议自行服用。肝肾功能不全者可能因代谢能力受限,影响灵芝孢子粉有效成分的清除和毒素的排出,增加肝肾负担。婴幼儿消化系统和免疫系统尚未发育完全,缺乏相关安全性研究,应禁止使用。