尿结石手术治疗有体外冲击波碎石术、输尿管镜碎石取石术、经皮肾镜碎石取石术等方式，不同类型治疗方法也不同。
1.体外冲击波碎石术
利用体外产生的冲击波聚焦后击碎体内的结石，使其随尿液排出体外。适用于直径较小（一般小于2厘米）的肾结石、输尿管上段结石等。对于适宜人群，结石能通过冲击波破碎并经尿路排出。但如果结石过硬等情况可能影响效果。
2.输尿管镜碎石取石术
通过尿道、膀胱插入输尿管镜，找到结石后利用激光、气压弹道等碎石设备将结石击碎并取出。适用于中下段输尿管结石、较大的肾结石等。对于输尿管中下段结石，输尿管镜可以较为直接地到达结石部位进行处理；对于一些较大的肾结石，也可通过此方式结合其他手段处理。
3.经皮肾镜碎石取石术
经腰部皮肤穿刺建立到达肾脏的通道，通过肾镜找到结石后进行碎石取石。适用于较大的肾结石，如直径大于2厘米的肾结石等。对于合适的肾结石患者，能有效地将结石取出。在年龄因素上，儿童进行经皮肾镜手术风险相对较高，因为儿童肾脏等组织更娇嫩，穿刺建立通道等操作难度大且并发症风险相对更高；老年人若有出血倾向等基础疾病，会增加手术中出血等风险，需要充分评估患者的凝血功能等情况。
