肛瘘的治疗以手术为主，辅助药物控制感染，需根据瘘管类型、位置及患者情况选择术式，术后需规范护理。
一、低位单纯性肛瘘：采用肛瘘切开术或肛瘘切除术，将内口至外口的瘘管切开或切除，形成新鲜创面逐步愈合，适用于瘘管较表浅、无复杂分支的病例。
二、低位复杂性肛瘘：可选择肛瘘切开挂线术，切开瘘管主干并保留内口处挂线，利用橡皮筋缓慢切割组织，保护肛门功能，同时结合肛瘘切除术处理分支瘘管。
三、高位肛瘘：多采用瘘管剔除术结合挂线疗法，高位瘘管需在直视下分离，避免损伤括约肌，挂线可减少术后肛门失禁风险，适用于瘘管位置较高、分支较多的情况。
四、合并感染或全身情况差者：先使用抗生素控制感染，待炎症缓解后再行手术，糖尿病患者需严格控制血糖，避免影响创面愈合，老年患者应评估手术耐受性，必要时选择微创术式。
特殊人群注意事项：婴幼儿肛瘘多为先天性，建议保守治疗至青春期，成人女性需注意经期卫生，避免术后感染，孕妇需权衡手术对妊娠的影响，优先选择安全术式。
