性别认知障碍在ICD-11中被定义为一种精神障碍，其核心是个体对自身性别的认知与出生时的生理性别存在显著不一致，导致持续心理痛苦或功能障碍，且需排除因躯体疾病或精神疾病引发的性别认知异常。
性别认知障碍可分为三种主要类型。首先是性别不安，表现为对自身生理性别产生强烈不适感，希望通过医疗手段改变性别特征，常见于青少年及成人。其次是性别不一致，即个体在性别认同与社会性别表现上存在冲突，如跨性别女性（出生为男性但认同女性性别）或跨性别男性（出生为女性但认同男性性别）。最后是其他特定性别相关障碍，涵盖部分未完全符合上述两类但存在显著性别认知问题的情况，如性别发育异常伴随的心理困扰。
性别认知障碍的诊断需满足特定时间范围与症状标准，通常要求症状持续至少6个月，且排除因躯体疾病（如性腺发育异常）或精神疾病（如躯体变形障碍）导致的继发性性别认知问题。诊断过程需由专业精神科医生或临床心理学家结合心理评估、访谈及相关量表完成。
治疗以多学科协作干预为主。心理治疗方面，激素治疗（如跨性别女性使用雌激素、跨性别男性使用睾酮）是重要手段，且需严格遵循适应症与禁忌症，药物使用需在专业医生指导下进行。社会支持系统的构建同样关键，包括家庭接纳、社会资源链接及就业指导，以减少歧视与社会压力。
对于儿童青少年群体，干预需谨慎。低龄儿童（<6岁）出现性别认知问题时，优先考虑心理教育与家庭支持，避免过早医疗干预。青春期前儿童若性别不安症状显著，可考虑短期心理干预，评估是否存在性别发育异常，如先天性肾上腺增生等。家长需关注儿童情绪状态，避免强化性别刻板印象，鼓励多元性别表达。
特殊人群需特别注意。跨性别女性在激素治疗期间需定期监测心血管与骨密度，跨性别男性需关注生育功能变化。老年人性别认知障碍干预需综合躯体健康状况，优先心理支持，减少医疗干预带来的风险。所有干预措施需以个体舒适度为核心，尊重自主选择，避免强迫性治疗。
