做眼睛激光手术的弊端包括术后干眼症、视力回退、夜间眩光等短期不适，以及感染、角膜瓣移位等并发症风险，部分患者还可能出现视力波动或矫正不足。
术后干眼症：手术会切断部分角膜神经，可能导致泪液分泌减少、泪膜稳定性下降，多数患者术后1-3个月内出现眼干、异物感，需长期使用人工泪液缓解。
视力回退与矫正不足：近视度数较高（＞600度）或角膜较薄者，术后可能因角膜组织修复、近视进展等导致视力回退，约1%-5%患者需二次手术补充矫正。
夜间视觉干扰：约10%-20%患者术后出现夜间眩光、光晕，尤其在暗环境下看灯光或驾驶时明显，多因切削区光学区与瞳孔直径不匹配，一般3-6个月逐渐适应。
特殊人群风险：未满18岁近视度数未稳定者，术后近视易进展；圆锥角膜、重度干眼症患者手术风险较高；糖尿病患者愈合能力差，感染概率增加。
长期并发症：极少数患者可能出现角膜扩张（圆锥角膜）、角膜瓣皱褶或移位，需及时就医干预；术后角膜抗冲击性下降，应避免剧烈运动或眼部外伤。
