自体干细胞移植存在一定弊端，可能引发感染、移植物抗宿主病、器官损伤等风险，且治疗过程复杂，需严格评估患者身体状况。
感染风险
移植后患者免疫功能严重受损，易发生细菌、真菌、病毒感染，如肺炎、败血症等。高龄患者、合并基础疾病者感染风险更高，需长期使用免疫抑制剂预防感染。
移植物抗宿主病
供体干细胞攻击受体组织，可累及皮肤、肝脏、肠道等，表现为皮疹、黄疸、腹泻等。急性GVHD多发生在移植后100天内，慢性GVHD可能持续数月至数年，需早期干预。
器官损伤
化疗预处理阶段可能损伤心、肝、肾等器官，导致功能不全。既往有基础疾病（如心脏病、肝病）的患者风险更高，需提前评估器官耐受能力。
长期并发症
部分患者可能出现继发肿瘤、内分泌紊乱（如甲状腺功能减退）、生育能力下降等。儿童患者需关注生长发育影响，建议治疗后长期随访监测。
特殊人群注意事项
高龄患者（≥60岁）、儿童及孕妇需谨慎评估移植风险，优先选择低强度预处理方案。合并严重感染或肝肾功能衰竭者不建议移植，需优先改善基础疾病。
