十六岁三个月没来月经是否严重，需结合具体情况判断。若初潮后不足两年，可能因青春期内分泌尚未稳定，属于相对常见现象；若初潮超过两年，或伴随其他症状，则需重视。
一、青春期初潮后两年内
初潮后月经周期建立需1-2年，三个月无月经可能是青春期功能失调性子宫出血的初期表现，需观察后续周期是否规律，避免过度节食或剧烈运动影响内分泌。
二、初潮超过两年
若初潮已超过两年，三个月无月经可能提示内分泌紊乱，如多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常等，需及时就医检查激素水平及妇科超声，排除器质性病变。
三、伴随症状需警惕
若出现体重明显变化、乳房发育异常、多毛、痤疮严重等症状，或伴随腹痛、乏力、面色苍白，可能提示疾病风险，应尽快就诊，明确诊断。
四、特殊情况处理
若近期有重大压力事件、过度减重或剧烈运动，需调整生活方式，恢复正常作息与营养摄入，观察1-2个周期，若仍异常，及时寻求专业医疗干预。
无论何种情况，均建议家长陪同青少年尽快到正规医疗机构妇科或内分泌科就诊，避免延误诊治。
