肉眼血尿的原因可能有泌尿系统疾病、全身性疾病、药物与化学因素等。
1.泌尿系统疾病
这是引起肉眼血尿最常见的原因。如肾小球肾炎，包括急性肾小球肾炎、急进性肾小球肾炎和慢性肾小球肾炎等，炎症损伤肾小球滤过膜，导致红细胞漏出到尿液中；泌尿系统结石，结石在肾脏、输尿管、膀胱等部位移动时，可划破尿路黏膜，引起出血；泌尿系统肿瘤，如肾癌、膀胱癌等，肿瘤组织生长迅速，表面血管破裂出血；泌尿系统感染，细菌等病原体感染尿路，造成尿路黏膜充血、水肿、糜烂，进而出血。
2.全身性疾病
血液系统疾病如血小板减少性紫癜、白血病等，会影响凝血功能，导致身体各部位容易出血，包括泌尿系统；感染性疾病如流行性出血热等，病毒感染可损伤全身小血管和毛细血管，引起肾脏等器官出血；心血管疾病如高血压肾病，长期高血压可导致肾脏小动脉硬化，肾实质缺血，出现血尿。
3.药物与化学因素
某些药物如磺胺类药物、环磷酰胺等可能对尿路黏膜产生刺激或损伤，引起血尿；接触化学物质如汞、铅等重金属，也可能损害肾脏，导致血尿。
