斜视手术后遗症主要包括术后短期的眼部红肿、异物感、畏光流泪（通常1~2周内缓解），以及长期可能出现的欠矫、过矫（需二次调整）、复视（常见于双眼手术者，多数3个月内恢复）、干眼症（因泪膜稳定性暂时受影响）。
术后短期反应：手术切口愈合过程中，眼部组织轻微水肿会导致暂时性视物模糊，需注意避免揉眼，遵医嘱使用抗生素及人工泪液。
欠矫或过矫：因个体斜视角度差异、肌肉力量评估误差可能发生，儿童调节性斜视术后欠矫风险相对较高，需定期复查调整。
复视与双眼协调问题：双眼手术者可能出现融合功能暂时紊乱，需通过立体视觉训练恢复，老年患者因融合功能退化，恢复周期更长。
干眼症：手术切断眼外肌可能影响泪腺分泌，术后需长期使用无防腐剂人工泪液，尤其长期伏案工作者需增加眼部湿润频率。
特殊人群注意：婴幼儿术后哭闹可能增加眼内压，需家长安抚并限制剧烈活动；糖尿病患者愈合速度慢，需严格控制血糖以降低感染风险。
