扁平疣由HPV3型等感染引起，好发青少年面部等，丘疹扁平光滑，病程慢性可自行消退；寻常疣多由HPV-2型感染，好发于任何年龄手足等，丘疹粗糙坚硬，病程长难自行消退。两者治疗有相似处，不同人群如儿童、女性、男性及有基础病史人群治疗各有需注意情况。
临床表现方面
扁平疣：好发于青少年，多见于面部、手背及前臂等部位。皮疹一般为米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑，质地较硬，正常肤色或淡褐色，多骤然出现，数目较多且密集，搔抓后可呈串珠状排列（同形反应）。
寻常疣：可发生于任何年龄，多见于手指、手背、足缘等处。典型皮疹为黄豆大小或更大的丘疹，表面粗糙，角化明显，触之坚硬，呈灰黄、污黄或正常肤色，初起多为单个，后可自身接种而增多。
病程方面
扁平疣病程慢性，有时可自行消退，消退前瘙痒明显，愈后不留瘢痕；寻常疣病程相对较长，一般不会自行消退，若受到外伤等刺激可能会迅速增大。
治疗方面
两者治疗方法有相似之处，都可采用物理治疗（如冷冻、激光等），但具体选择需根据患者情况等决定。对于扁平疣，还可使用一些调节免疫的药物；寻常疣也可根据情况选择合适的治疗方式，比如对于较小的寻常疣也可尝试外用药物等，但治疗原则基本都是去除疣体、调节免疫等。
特殊人群情况
儿童：儿童是扁平疣和寻常疣的好发人群，尤其是扁平疣在青少年中多见。儿童皮肤娇嫩，在治疗时物理治疗需更加谨慎，要考虑对儿童皮肤损伤程度及心理影响等。比如冷冻治疗时要注意控制冷冻范围和时间，避免过度冷冻影响儿童皮肤正常发育，激光治疗要选择合适的参数，减少对儿童皮肤的创伤。同时，儿童免疫系统发育不完善，寻常疣有时可能会因为儿童自身免疫状态变化而有不同表现，家长要注意观察儿童皮肤情况，若皮疹有异常变化及时就医。
女性：女性在外观上可能更关注扁平疣和寻常疣对皮肤美观的影响，尤其是发生在面部等暴露部位的扁平疣，会更在意治疗后的皮肤恢复情况，在选择治疗方法时可能更倾向于对皮肤美观影响较小的方式，但仍需遵循医学治疗原则。
男性：男性长寻常疣等情况时，若发生在手部等部位，可能会因为日常劳动等受到影响，在治疗时要考虑对其正常生活和工作的影响，选择合适的治疗时机和方法，保障治疗效果同时不影响正常的体力活动等。
有基础病史人群：对于本身有免疫性疾病等基础病史的人群，患扁平疣或寻常疣时，治疗需更加谨慎。比如免疫功能低下的人群，病毒感染可能更难控制，在选择治疗方法和药物时要综合考虑基础疾病情况，避免因为治疗疣而影响基础疾病的控制，或因为基础疾病影响疣的治疗效果。同时，治疗过程中要密切观察病情变化和药物等治疗手段对基础疾病的影响。
