自然流产的发生主要与胚胎染色体异常、母体内分泌失调、子宫结构异常、感染因素及免疫功能异常等相关，其中染色体异常占早期流产的50%~60%。
胚胎染色体异常：多数早期流产由胚胎染色体非整倍体（如21三体、18三体）或结构异常导致，与父母遗传物质异常或胚胎发育过程中染色体分离错误有关，高龄孕妇（≥35岁）风险更高。
母体内分泌失调：甲状腺功能减退、多囊卵巢综合征（PCOS）、高泌乳素血症等内分泌疾病，或黄体功能不足（孕酮水平低），影响胚胎着床及维持妊娠，糖尿病血糖控制不佳也会增加风险。
子宫结构异常：先天性子宫畸形（如双角子宫、纵隔子宫）、宫腔粘连、子宫肌瘤（尤其是黏膜下肌瘤）或宫颈机能不全（孕中晚期宫颈松弛），影响子宫环境稳定性，增加流产概率。
感染与免疫因素：生殖道感染（如支原体、衣原体感染）、严重全身性感染（如流感病毒感染）或自身免疫性疾病（如系统性红斑狼疮），可能引发免疫排斥反应或炎症反应，干扰妊娠维持。
其他高危因素：长期吸烟、酗酒、过度劳累、精神压力大、肥胖或营养不良等不良生活方式，也可能通过影响内分泌、免疫及子宫血流，增加流产风险。
