非细菌性前列腺炎治疗药物选择需结合症状类型与个体情况。慢性骨盆疼痛综合征是主要类型，可选用α受体阻滞剂、非甾体抗炎药、植物制剂及抗抑郁药等缓解症状。
对于以排尿症状（尿频、尿急）为主的患者，α受体阻滞剂能松弛前列腺和膀胱颈部平滑肌，改善排尿困难。
以疼痛症状（会阴部、腰骶部不适）为主的患者，非甾体抗炎药可减轻局部炎症反应，缓解疼痛；植物制剂如锯叶棕果实提取物等也有一定疗效。
合并焦虑、抑郁情绪的患者，可在医生指导下短期使用抗抑郁药，改善躯体不适与心理状态。
特殊人群需注意：老年患者慎用抗胆碱能药物，避免尿潴留风险；孕妇及哺乳期女性需严格遵医嘱，优先选择对胎儿影响小的药物；儿童患者应避免使用成人药物，以物理治疗和生活方式调整为主。
