肾结石可引发多种症状，包括肾区疼痛（多数隐痛或胀痛，活动致输尿管梗阻时出现剧烈肾绞痛并放射）、腹痛（部位不固定）；血尿（肉眼或镜下血尿，活动后加重）；排尿异常（结石合并感染或刺激膀胱黏膜致尿频、尿急、尿痛，较大结石等致排尿困难）；其他症状有恶心、呕吐（肾绞痛时刺激致恶心呕吐且不缓解）、发热（合并严重尿路感染时出现）、肾功能异常（长期大结石致尿路梗阻影响肾功能，儿童影响生长发育，老年加重基础疾病）。
腹痛：部分患者可能表现为腹部隐痛或胀痛，疼痛部位不太固定，可能与结石在泌尿系统内的位置移动有关。
血尿
肉眼血尿或镜下血尿：结石可损伤肾盂、输尿管黏膜，导致出血，从而引起血尿。有的患者可出现肉眼可见的血尿，尿液呈洗肉水样或鲜红色；有的则需要通过显微镜检查尿液才能发现红细胞，即镜下血尿。一般来说，活动后血尿症状可能会加重，这是因为活动会促使结石与黏膜进一步摩擦，导致出血增多。
排尿异常
尿频、尿急、尿痛：如果结石合并感染，或结石刺激膀胱黏膜，患者可能出现尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。尿频是指排尿次数明显增多，尿急是指突然产生强烈的排尿欲望且很难控制，尿痛则是指排尿时尿道或会阴部产生疼痛。例如，当结石引起泌尿系统感染时，约有30%-50%的患者会出现尿频、尿急、尿痛等症状。
排尿困难：较大的结石或结石位于尿道内口等部位时，可能会阻碍尿液排出，导致排尿困难，表现为尿流变细、排尿费力等。
其他症状
恶心、呕吐：肾绞痛发作时，疼痛可刺激交感神经，反射性引起胃肠道反应，导致患者出现恶心、呕吐症状，且呕吐后疼痛往往无明显缓解。
发热：当肾结石合并尿路感染且感染较为严重时，患者可出现发热症状，体温可升高至38℃-39℃甚至更高，同时可能伴有寒战。这是因为细菌感染导致炎症反应，身体启动发热机制来对抗感染。
肾功能异常：长期存在的较大肾结石，可能会引起尿路梗阻，进而影响肾功能，导致肾小球滤过率下降等，严重时可出现少尿、无尿等情况，同时可能伴有血肌酐、尿素氮升高等肾功能指标异常。对于儿童患者，长期肾结石导致的肾功能异常可能会影响其生长发育，因为肾脏功能异常会影响体内代谢废物的排出以及一些重要激素的调节等；老年患者肾功能异常可能会加重其基础疾病，如心血管疾病等，因为肾功能不全可能导致水钠潴留，加重心脏负担。
