治疗慢性子宫内膜炎的药物以抗生素为主，需根据病原体类型选择敏感抗生素（如甲硝唑、克林霉素等）；部分情况辅以非甾体抗炎药或中成药缓解症状，具体用药需由医生评估后确定。
抗生素治疗是核心，常见致病菌包括厌氧菌（如脆弱拟杆菌）、支原体、衣原体及需氧菌（如链球菌）等。针对厌氧菌可选用甲硝唑，支原体衣原体感染可选用多西环素或阿奇霉素，需氧菌感染可选用头孢类抗生素，用药需结合药敏试验或临床经验。
对于慢性炎症引起的盆腔疼痛、分泌物异常等症状，可短期使用非甾体抗炎药（如布洛芬）缓解不适，但长期使用可能增加胃肠道副作用风险，需谨慎。
部分清热解毒、活血化瘀类中成药在临床研究中显示可辅助改善症状，缩短炎症持续时间，使用时需在医生指导下进行，避免与抗生素产生相互作用。
特殊人群用药需谨慎，孕妇优先选择对胎儿影响小的抗生素（如青霉素类）；哺乳期女性使用甲硝唑等药物后需暂停哺乳；肝肾功能不全者慎用氨基糖苷类抗生素，需调整剂量或更换药物；老年患者因代谢能力下降，需加强药物安全性监测。无论何种人群，在药物治疗期间，保持规律作息、避免不洁性生活等非药物干预措施可辅助提升治疗效果。
