新生儿结膜炎治疗需根据病因分类处理。细菌性结膜炎需及时使用抗生素滴眼液，病毒性结膜炎以对症支持为主，衣原体性结膜炎需规范抗感染治疗，过敏性结膜炎则需规避过敏原并使用抗过敏药物。
细菌性结膜炎：由淋球菌或链球菌感染引起，表现为眼睑红肿、黄色分泌物多。需在出生后24小时内开始抗生素滴眼液治疗，首选广谱抗生素，治疗期间需严格清洁眼周分泌物，避免交叉感染。
病毒性结膜炎：多由腺病毒或疱疹病毒引发，分泌物较稀薄，常伴眼痒。以人工泪液清洁眼部、冷敷缓解不适为主，必要时使用抗病毒滴眼液，需注意患儿免疫状态，避免继发感染。
衣原体性结膜炎：由沙眼衣原体导致，表现为眼睑内翻、乳头增生。需用大环内酯类抗生素治疗，治疗周期较长，需定期复查以确保彻底清除病原体，同时注意家庭环境消毒，防止反复感染。
过敏性结膜炎：接触过敏原（如花粉、尘螨）后发病，眼痒明显。需立即脱离过敏原，使用抗组胺滴眼液缓解症状，避免揉眼加重刺激，婴幼儿应避免接触已知过敏物质，必要时在医生指导下使用糖皮质激素滴眼液。
特殊人群注意事项：早产儿、低体重儿用药需谨慎，优先选择安全性高的药物；母乳喂养婴儿母亲需注意个人卫生，避免共用毛巾等物品；有家族过敏史的新生儿需提前预防，定期检查眼部情况。
