芒果虽营养丰富，但食用存在过敏、肠胃刺激、药物相互作用等禁忌，特殊人群及食用方式需特别注意，合理食用方能兼顾健康与口感。
芒果含漆酚等致敏成分，过敏体质者食用后易出现皮疹、口腔瘙痒，花粉过敏者需警惕交叉过敏。研究显示，生食芒果接触口腔黏膜更易诱发过敏反应，建议首次食用取少量果肉试吃，避免汁液接触皮肤。
芒果含糖量约14%（升糖指数55），糖尿病患者过量食用易致血糖波动，WHO建议糖尿病患者每日糖分摄入≤25g，1个中等芒果约含21g糖，需计入总碳水化合物；其果酸与膳食纤维可加重脾胃虚寒者腹泻、腹胀，成人每日食用量建议≤1个中等果实。
芒果果酸可能影响四环素类抗生素吸收，与华法林等抗凝血药同服时，可能增强药效增加出血风险。《美国临床营养学杂志》提示，鞣花酸或影响药物代谢酶活性，服用上述药物期间需咨询医生调整食用量。
肾功能不全者因排钾能力下降，芒果高钾含量（238mg/100g）易诱发高钾血症；婴幼儿消化系统发育不全，过量食用易致消化不良；孕妇需控制总量，避免糖分超标引发妊娠糖尿病，建议每日不超过半个中等芒果。
未成熟芒果含鞣酸多，酸涩刺激肠胃易引发恶心呕吐，应选择表皮金黄、手感软的成熟果实；食用时彻底去皮去核，避免汁液残留皮肤引发接触性皮炎，可用淡盐水清洗；变质芒果滋生毒素，严禁食用以防食物中毒。
