冠状病毒起源推测包括自然宿主和中间宿主，SARS冠状病毒自然宿主是蝙蝠、中间宿主是果子狸；MERS-CoV自然宿主是蝙蝠、中间宿主可能是单峰骆驼；新型冠状病毒自然宿主是蝙蝠、中间宿主待进一步研究。
中间宿主推测：在从蝙蝠到人类的传播过程中，可能存在中间宿主。比如，2003年引起严重急性呼吸综合征（SARS）的冠状病毒，研究发现其中间宿主极有可能是果子狸。通过对果子狸体内病毒的检测和基因比对，发现与SARS患者体内分离出的病毒基因高度相似。中间宿主在病毒传播链中起到了将病毒从自然宿主传播到人类的桥梁作用，由于中间宿主与人类的接触机会相对较多，从而增加了病毒传播给人类的风险。
不同冠状病毒的具体起源情况
SARS冠状病毒：经过多年的研究，确定SARS冠状病毒的自然宿主是蝙蝠，中间宿主为果子狸。科学家通过对不同地区蝙蝠携带的冠状病毒进行追踪和分析，逐步构建了SARS冠状病毒的起源传播链。最初在蝙蝠体内发现了与SARS病毒基因相似性较高的病毒，然后通过果子狸等中间宿主将病毒传播给人类，导致了2003年SARS疫情在全球范围内的爆发。
中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）：研究表明，MERS-CoV的自然宿主是蝙蝠，其中间宿主可能是单峰骆驼。对沙特阿拉伯等地区的单峰骆驼进行病毒检测，发现骆驼体内存在与MERS-CoV基因序列相似的病毒。通过进一步的流行病学调查和病毒学研究，确定了单峰骆驼在MERS冠状病毒从蝙蝠传播到人类过程中的中间宿主角色，人类主要是通过接触感染病毒的骆驼及其分泌物等而被感染。
新型冠状病毒（2019-nCoV）：目前研究推测其自然宿主也是蝙蝠，关于中间宿主还在进一步的研究中。通过对2019-nCoV的基因序列进行分析，发现其与蝙蝠体内的某些冠状病毒基因序列具有较高的同源性。后续需要进一步开展广泛的野生动物监测和病毒学调查来确定可能的中间宿主，从而更好地了解该病毒的完整传播链条。
