脑炎后遗症可引发多种问题，包括运动功能障碍致肢体力量减弱、活动受限，影响儿童生长发育和成年患者生活自理；认知障碍致记忆力减退、注意力不集中，影响儿童学业和成年患者工作；语言障碍致说话不清、表达困难等，阻碍儿童社交和成年患者沟通；常引发癫痫致反复发作，影响身心健康；还会致精神行为异常，如情绪不稳定、行为异常，影响儿童学校表现和成年患者家庭、工作关系。
认知障碍
患者可能出现认知方面的异常，包括记忆力减退，难以记住近期发生的事情、学习新知识困难等。还可能有注意力不集中的表现，无法长时间专注于某件事情。这是由于脑炎损伤了大脑中与记忆、学习、注意力等认知功能相关的脑区，如海马体等结构。在儿童脑炎后遗症患者中，认知障碍会严重影响其学业进展，导致学习成绩落后；成年患者则可能在工作中出现效率低下、难以胜任复杂工作任务等情况。
语言障碍
部分脑炎后遗症患者会有语言障碍，表现为说话不清、表达困难，可能出现失语症，如运动性失语，患者能理解他人语言，但自己无法流畅表达；感觉性失语则是能说话，但说的内容无法被理解。这是因为脑炎累及了语言中枢相关区域，影响了语言的编码、解码等过程。对于儿童患者，语言障碍会阻碍其与外界的正常沟通交流，影响社交能力的发展；成年患者则会在人际交往和职业发展中面临沟通方面的困难。
癫痫发作
脑炎后遗症常可引发癫痫，患者会出现反复发作的癫痫症状，如突然的肢体抽搐、意识丧失、口吐白沫等。这是因为脑炎导致大脑神经元异常放电，破坏了大脑电活动的平衡。癫痫发作对患者的身心健康影响较大，频繁发作可能会导致患者身体受伤，如在抽搐时摔倒磕碰等，还会对患者的心理造成压力，影响其生活质量和心理健康状况，无论是儿童还是成年患者，都需要长期关注和进行相应的癫痫管理。
精神行为异常
一些脑炎后遗症患者会出现精神行为方面的改变，比如情绪不稳定，容易激动、烦躁或抑郁；行为异常，可能出现无目的的躁动、攻击性行为等。这是由于脑炎影响了大脑中调节情绪和行为的神经递质系统及相关脑区功能。儿童患者的精神行为异常可能会影响其在学校的表现和与同学的关系；成年患者则可能导致家庭关系紧张、工作场所适应困难等问题。
