艾滋病有急性期（初感染后2-4周，有发热等症状，HIVRNA及P24抗原可检）、无症状期（持续6-8年，HIV复制、免疫受损）、艾滋病期（免疫缺陷表现及机会性感染、肿瘤，CD4+T淋巴细胞计数低，有相关症状及疾病）；梅毒有一期（感染后2-4周生殖器硬下疳，儿童母婴传播后病情进展快）、二期（感染后7-10周或硬下疳后6-8周，皮肤黏膜损害等，孕期感染致胎儿问题）、三期（感染后2-15年，皮肤黏膜损害及心血管、神经系统受累，儿童先天性三期梅毒少见且严重）。
通常发生在初次感染HIV后2-4周左右。部分感染者会出现发热、咽痛、盗汗、呕吐、腹泻、皮疹、关节痛、淋巴结肿大以及神经系统症状等。发热多为持续性低热，可伴有全身不适，此时血液中可检测到HIVRNA及P24抗原，而HIV抗体则在感染后数周才出现。年龄较小的儿童感染后可能症状更不典型，容易被忽视，且可能出现生长发育迟缓等情况；女性感染者在孕期感染可能会影响胎儿发育。
无症状期
此期持续时间一般为6-8年，但也有短至数月，长至15年的情况。在这个阶段，患者没有明显的症状，然而体内的HIV在持续复制，免疫系统受损逐渐加重，CD4+T淋巴细胞计数逐渐下降。不同生活方式的人群，如长期熬夜、吸烟、酗酒者，免疫系统本身相对较弱，可能会使病情进展相对更快；有基础疾病的患者感染HIV后，可能会相互影响病情发展。
艾滋病期
严重的免疫缺陷表现：CD4+T淋巴细胞计数明显下降，多低于200个/μL。患者会出现持续1个月以上的发热、盗汗、腹泻，体重减轻常超过10%。还可能出现记忆力减退、精神淡漠、性格改变、头痛、癫痫及痴呆等神经系统症状。儿童患者可能会出现生长发育停滞，表现为身高、体重明显低于同龄儿童。女性患者在孕期如果处于艾滋病期，可能会发生流产、早产、死产等情况。
各种机会性感染及肿瘤：可发生肺孢子菌肺炎，这是艾滋病患者最常见的机会性感染之一，表现为发热、干咳、进行性呼吸困难等；还可能出现念珠菌食管炎、巨细胞病毒性视网膜炎、弓形虫脑病、马尔尼菲篮状菌病等多种机会性感染；肿瘤方面，常见卡波西肉瘤，表现为皮肤多发性结节样病变，也可累及胃肠道等部位，此外还可能发生非霍奇金淋巴瘤等。
梅毒症状
一期梅毒
主要表现为硬下疳，通常在感染梅毒螺旋体后2-4周出现。一般发生在生殖器部位，男性多在阴茎冠状沟、龟头、包皮等部位，女性多在大小阴唇、宫颈等部位。硬下疳开始为小红斑，迅速发展为无痛性炎性丘疹，数天内丘疹扩大形成硬结，表面发生坏死，形成单个直径1-2cm、圆形或椭圆形无痛性溃疡，边界清楚，周边水肿并隆起，基底呈肉红色，触之具有软骨样硬度，表面有浆液性分泌物，内含大量梅毒螺旋体，传染性极强。儿童感染一期梅毒多是通过母婴传播，可能会出现皮肤黏膜损害等表现，且病情进展可能相对成人更快，需要特别关注。
二期梅毒
一般发生在感染后7-10周或硬下疳出现后6-8周。皮肤黏膜损害是其主要表现，可出现梅毒疹，如斑疹、丘疹、脓疱等，分布广泛，对称，不痛不痒，常伴有扁平湿疣，好发于肛门周围、外生殖器等部位，为湿润的扁平丘疹，内含大量梅毒螺旋体。还可能出现脱发、骨关节损害、眼损害、神经损害等。女性患者在孕期感染二期梅毒，可能会导致胎儿流产、早产、死胎或新生儿先天性梅毒。
三期梅毒
又称晚期梅毒，一般在感染后2-15年发生。皮肤黏膜损害主要为结节性梅毒疹和树胶肿。结节性梅毒疹好发于头面部、肩背及四肢伸侧，为皮下结节，质地硬，可溃破；树胶肿是三期梅毒的标志，也是破坏性最大的一种损害，初为皮下小硬结，逐渐增大与皮肤粘连，形成浸润性斑块，中心逐渐软化破溃，流出黏稠树胶状脓汁，愈后形成瘢痕。还可累及心血管系统，引起梅毒性主动脉炎、主动脉瓣闭锁不全、主动脉瘤等；累及神经系统，引起麻痹性痴呆、脊髓痨等。儿童先天性三期梅毒相对少见，但一旦发生，可能会出现骨膜炎、肝脾肿大、贫血等多种严重表现。
